More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0791 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  100 
 
 
378 aa  767    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  82.61 
 
 
372 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4009  peptide chain release factor 2  75.47 
 
 
378 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2479  peptide chain release factor 2  74.8 
 
 
375 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3724  peptide chain release factor 2  68.73 
 
 
372 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976821  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  73.88 
 
 
369 aa  542  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1405  peptide chain release factor 2  69.86 
 
 
368 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.577289  normal  0.45049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0944  peptide chain release factor 2  68.85 
 
 
367 aa  524  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1637  peptide chain release factor 2  68.22 
 
 
369 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154678  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1911  peptide chain release factor 2  67.76 
 
 
368 aa  511  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212403  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1579  peptide chain release factor 2  66.4 
 
 
371 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  67.85 
 
 
373 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1608  peptide chain release factor 2  66.12 
 
 
371 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1633  peptide chain release factor 2  66.12 
 
 
371 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4451  peptide chain release factor 2  66.22 
 
 
372 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2771  peptide chain release factor 2  66.58 
 
 
374 aa  501  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.777287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0917  peptide chain release factor 2  66.12 
 
 
373 aa  501  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.640596  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3782  peptide chain release factor 2  63.59 
 
 
367 aa  498  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.894943  normal  0.808138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1233  peptide chain release factor 2  70.19 
 
 
370 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07690  peptide chain release factor 2  68.52 
 
 
368 aa  492  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10410  peptide chain release factor 2  63.46 
 
 
370 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.232549  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3456  peptide chain release factor 2  66.2 
 
 
371 aa  485  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3025  peptide chain release factor 2  64.56 
 
 
371 aa  477  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0791  peptide chain release factor 2  65.48 
 
 
366 aa  478  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1034  peptide chain release factor 2  62.91 
 
 
370 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1243  peptide chain release factor 2  62.67 
 
 
371 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.371008  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20340  peptide chain release factor 2  62.71 
 
 
371 aa  472  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0863  peptide chain release factor 2  63.84 
 
 
369 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2401  peptide chain release factor 2  62.43 
 
 
371 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0455309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1865  peptide chain release factor 2  67.21 
 
 
376 aa  465  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00679931  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07580  peptide chain release factor 2  59.68 
 
 
373 aa  461  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.932102  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13122  peptide chain release factor 2  65.77 
 
 
378 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.44652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2666  peptide chain release factor 2  61.05 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1073  peptide chain release factor 2  58.13 
 
 
378 aa  454  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25200  peptide chain release factor 2  60.43 
 
 
372 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0337024  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1264  peptide chain release factor 2  65.18 
 
 
375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111402  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0942  peptide chain release factor 2  59.03 
 
 
374 aa  444  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0440008  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5798  peptide chain release factor 2  64.93 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.702249 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2552  hypothetical protein  52.1 
 
 
383 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  52.92 
 
 
372 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  52.6 
 
 
366 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  51.11 
 
 
357 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  53.49 
 
 
364 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  52.08 
 
 
377 aa  363  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  50.57 
 
 
372 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3194  hypothetical protein  50.28 
 
 
367 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3258  hypothetical protein  50.55 
 
 
371 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  52.39 
 
 
367 aa  360  3e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  50.84 
 
 
366 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2206  hypothetical protein  50.43 
 
 
373 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  47.77 
 
 
366 aa  356  3.9999999999999996e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2735  hypothetical protein  48.6 
 
 
372 aa  354  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2428  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 
362 aa  352  5e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2038  peptide chain release factor 2  52.14 
 
 
361 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.763789  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2138  peptide chain release factor 2  49.29 
 
 
364 aa  349  4e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  46.61 
 
 
367 aa  346  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1356  peptide chain release factor 2  49.28 
 
 
369 aa  345  1e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0131185  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3007  hypothetical protein  49.44 
 
 
367 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000736881  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  48.27 
 
 
369 aa  343  2.9999999999999997e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1248  peptide chain release factor 2  48.58 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.631536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  46.87 
 
 
367 aa  342  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6050  hypothetical protein  52.51 
 
 
375 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0534782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1002  peptide chain release factor 2  52.38 
 
 
340 aa  342  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000036065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  51.22 
 
 
330 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  50 
 
 
364 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  55.03 
 
 
317 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4239  peptide chain release factor 2  50.91 
 
 
341 aa  339  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0696744 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2079  peptide chain release factor 2  54.32 
 
 
330 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1762  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 
369 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.602525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0748  peptide chain release factor 2  49.72 
 
 
372 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01981  peptide chain release factor 2  49.56 
 
 
356 aa  335  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.823612  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  49.18 
 
 
365 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0813  peptide chain release factor 2  47.95 
 
 
374 aa  334  2e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  48.64 
 
 
365 aa  333  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3423  hypothetical protein  48.37 
 
 
365 aa  333  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0838102  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 
365 aa  333  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0801  hypothetical protein  48.91 
 
 
365 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000691536  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 
365 aa  333  4e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  48.91 
 
 
365 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  50.44 
 
 
362 aa  332  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2124  peptide chain release factor 2  49.41 
 
 
356 aa  332  8e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66989  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2694  hypothetical protein  48.76 
 
 
375 aa  332  9e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.352296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3422  hypothetical protein  48.76 
 
 
365 aa  331  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4746  hypothetical protein  48.82 
 
 
368 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  48.37 
 
 
365 aa  331  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0939  hypothetical protein  49.15 
 
 
376 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5555  hypothetical protein  50.57 
 
 
378 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.12714  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2678  hypothetical protein  45.73 
 
 
367 aa  330  3e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4010800000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5293  peptide chain release factor 2  45.3 
 
 
380 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  49.26 
 
 
357 aa  329  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  48.64 
 
 
365 aa  329  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  48.99 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  48.7 
 
 
349 aa  328  9e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  48.97 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0478  peptide chain release factor 2  51.25 
 
 
330 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000728254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2715  peptide chain release factor 2  49.57 
 
 
360 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5165  peptide chain release factor 2  47.65 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.847657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  49.85 
 
 
343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  47.19 
 
 
365 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09020  peptide chain release factor 2  48.49 
 
 
369 aa  327  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.140459  normal  0.0325774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>