91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3486 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3835  glycoside hydrolase, clan GH-D  60.81 
 
 		 719 aa  834    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.377563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3486  glycoside hydrolase, clan GH-D  100 
 
 		 688 aa  1401    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3687  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.97 
 
 		 718 aa  434  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0371058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2493  glycoside hydrolase clan GH-D  36.3 
 
 		 708 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1681  alpha-galactosidase  36.3 
 
 		 708 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310145  normal  0.0290981 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4077  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.88 
 
 		 707 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.360129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2014  glycoside hydrolase, clan GH-D  37.37 
 
 		 700 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.63887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0633  glycoside hydrolase clan GH-D  37.96 
 
 		 714 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2395  alpha-galactosidase AgaN  36.3 
 
 		 708 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000211341  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3114  alpha-galactosidase  36.58 
 
 		 708 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.024409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3380  alpha-galactosidase  36.58 
 
 		 708 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2658  glycoside hydrolase clan GH-D  37.19 
 
 		 709 aa  402  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0847  glycoside hydrolase clan GH-D  37.66 
 
 		 714 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1331  glycoside hydrolase clan GH-D  36.76 
 
 		 709 aa  394  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.816574  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4910  glycoside hydrolase clan GH-D  38.52 
 
 		 715 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1749  glycoside hydrolase clan GH-D  38.16 
 
 		 724 aa  389  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000205426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1776  glycoside hydrolase clan GH-D  37.78 
 
 		 718 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.191926  normal  0.0421989 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3246  glycoside hydrolase clan GH-D  38.35 
 
 		 728 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2815  alpha-galactosidase  36.15 
 
 		 736 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1181  alpha-galactosidase  36.15 
 
 		 723 aa  379  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207632  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32900  alpha-galactosidase  36.39 
 
 		 727 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386301  normal  0.54017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4826  glycoside hydrolase clan GH-D  36.71 
 
 		 724 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.482149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5740  Alpha-galactosidase  36.73 
 
 		 701 aa  368  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6181  glycoside hydrolase clan GH-D  37.24 
 
 		 707 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.935371  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31550  alpha-galactosidase  38.77 
 
 		 704 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.135548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3388  glycoside hydrolase, clan GH-D  35.83 
 
 		 735 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2011  glycoside hydrolase clan GH-D  35.56 
 
 		 722 aa  359  9e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2118  glycoside hydrolase clan GH-D  35.92 
 
 		 721 aa  356  6.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2479  glycoside hydrolase clan GH-D  37.09 
 
 		 740 aa  347  6e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51410  Glycoside hydrolase, clan GH-D  36.47 
 
 		 733 aa  346  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1878  glycoside hydrolase, clan GH-D  36.08 
 
 		 699 aa  344  2.9999999999999997e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1094  glycoside hydrolase clan GH-D  38.96 
 
 		 730 aa  339  9.999999999999999e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0699793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2816  glycoside hydrolase clan GH-D  33.88 
 
 		 726 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.964152 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0260  glycoside hydrolase clan GH-D  34.59 
 
 		 723 aa  333  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07480  alpha-galactosidase  35.96 
 
 		 747 aa  332  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3471  glycoside hydrolase clan GH-D  37.93 
 
 		 733 aa  329  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1771  glycoside hydrolase clan GH-D  39.29 
 
 		 747 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.145856  normal  0.079989 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1483  alpha-galactosidase  32.16 
 
 		 768 aa  326  9e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0786  glycoside hydrolase clan GH-D  35.77 
 
 		 734 aa  291  3e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1670  glycoside hydrolase clan GH-D  33.33 
 
 		 726 aa  290  7e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0528  glycoside hydrolase clan GH-D  32.07 
 
 		 729 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0257  Alpha-galactosidase  30.19 
 
 		 743 aa  289  1e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000661357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0468  glycoside hydrolase clan GH-D  31.66 
 
 		 729 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000274987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2439  glycoside hydrolase clan GH-D  33.18 
 
 		 699 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000265114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1094  glycoside hydrolase, clan GH-D  31.56 
 
 		 733 aa  280  6e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0882  Alpha-galactosidase  32.13 
 
 		 740 aa  271  2.9999999999999997e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.24278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3056  glycoside hydrolase clan GH-D  30.67 
 
 		 729 aa  270  8e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0910  glycoside hydrolase, clan GH-D  30.5 
 
 		 729 aa  268  2e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000647683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0072  glycoside hydrolase clan GH-D  30.16 
 
 		 739 aa  264  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.723397  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1781  Alpha-galactosidase  31.45 
 
 		 729 aa  261  3e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.725513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1936  glycoside hydrolase clan GH-D  30.55 
 
 		 818 aa  261  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0237  glycoside hydrolase clan GH-D  30.09 
 
 		 722 aa  260  6e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09035  Putative alpha-galactosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5ARP5]  33.11 
 
 		 726 aa  259  8e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2552  glycoside hydrolase clan GH-D  33.38 
 
 		 701 aa  257  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08138  AGLC_ASPNG Alpha-galactosidase C (Melibiase)Alpha-galactosidase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU92]  32.25 
 
 		 750 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.261984 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0491  alpha-galactosidase  27.41 
 
 		 734 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0475  alpha-galactosidase  26.8 
 
 		 730 aa  252  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1453  alpha-galactosidase  33.13 
 
 		 774 aa  249  9e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0825  glycoside hydrolase clan GH-D  31.11 
 
 		 713 aa  231  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1907  glycoside hydrolase clan GH-D  29.2 
 
 		 730 aa  231  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.506598  normal  0.205368 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0855  glycoside hydrolase clan GH-D  35.01 
 
 		 716 aa  229  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.705806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0943  glycoside hydrolase clan GH-D  32.96 
 
 		 713 aa  219  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.929701 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1706  glycoside hydrolase clan GH-D  28.91 
 
 		 727 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.499482  normal  0.0124304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5645  glycoside hydrolase clan GH-D  26.4 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2448  glycoside hydrolase clan GH-D  36.72 
 
 		 530 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3563  glycoside hydrolase clan GH-D  28.7 
 
 		 684 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.255741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1356  glycoside hydrolase, clan GH-D  28.23 
 
 		 683 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3567  glycoside hydrolase clan GH-D  24.84 
 
 		 675 aa  91.3  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  0.341251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1360  glycoside hydrolase, clan GH-D  24.58 
 
 		 674 aa  90.9  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2324  glycoside hydrolase clan GH-D  28.31 
 
 		 657 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0818659  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08392  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  28.91 
 
 		 732 aa  84.3  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.010447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2515  glycoside hydrolase clan GH-D  25.12 
 
 		 679 aa  79  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0130  glycoside hydrolase clan GH-D  30.5 
 
 		 669 aa  78.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0394459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2915  glycoside hydrolase clan GH-D  26.38 
 
 		 706 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5180  glycoside hydrolase clan GH-D  27.01 
 
 		 700 aa  74.7  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2514  glycoside hydrolase clan GH-D  28.4 
 
 		 723 aa  71.2  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1295  putative alpha-1,6-galactosidase  25 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06470  alpha-galactosidase  35.92 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0417  glycoside hydrolase clan GH-D  27.1 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0315  glycoside hydrolase clan GH-D  23.51 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.648797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2812  glycoside hydrolase clan GH-D  28.69 
 
 		 484 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0811022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003824  alpha-1,6-galactosidase putative  23.11 
 
 		 579 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.367398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01858  alpha-1,6-galactosidase  24.68 
 
 		 579 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0304  glycoside hydrolase clan GH-D  28.39 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50372  predicted protein  25.86 
 
 		 1020 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0944  glycoside hydrolase/PKD  24.16 
 
 		 824 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.321699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0423  Alpha-galactosidase-like protein  27.27 
 
 		 555 aa  46.6  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  33.33 
 
 		 411 aa  45.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  29.21 
 
 		 407 aa  45.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1987  Alpha-galactosidase-like protein  31.07 
 
 		 782 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20916  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6587  hypothetical protein  25.43 
 
 		 579 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>