More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0985 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0985  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  100 
 
 		 645 aa  1330    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00011806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0988  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  37.01 
 
 		 647 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.356739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00641  ABC oligopeptide transporter periplasmic component  34.63 
 
 		 609 aa  317  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02855  hypothetical protein  33.06 
 
 		 615 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001852  ABC-type dipeptide transport system component  34.52 
 
 		 608 aa  303  7.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003025  ABC-type dipeptide transport system component  33.5 
 
 		 612 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561815  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0869  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 		 626 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0942  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 621 aa  281  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1853  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 734 aa  197  5.000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1685  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 668 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0732988  normal  0.758738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  25.09 
 
 		 615 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 615 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3486  ABC transporter periplasmic binding protein  24.56 
 
 		 615 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  23.41 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0249  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 670 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3535  twin-arginine translocation pathway signal  23.38 
 
 		 631 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7054  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.19 
 
 		 614 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.334122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.25 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 610 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1770  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 635 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.035612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 609 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  24.82 
 
 		 626 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1771  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 625 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.235807  normal  0.0344403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2181  extracellular solute-binding protein  25.05 
 
 		 613 aa  107  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0845  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 638 aa  107  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0910462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4214  extracellular solute-binding protein family 5  23.2 
 
 		 631 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1506  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 604 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0138783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 		 627 aa  104  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  22.42 
 
 		 602 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 650 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 650 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 650 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2856  putative oligopeptide ABC transporter, periplasmic-binding protein  23.26 
 
 		 603 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481742  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 616 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_004310  BR0010  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.54 
 
 		 622 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.427067  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 611 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 624 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 627 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  24.29 
 
 		 609 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 609 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 641 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 611 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 624 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.82 
 
 		 628 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.19 
 
 		 936 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2567  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 601 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2786  extracellular solute-binding protein  21.98 
 
 		 602 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426757  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1437  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 603 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0112279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2456  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2365  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0436387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2453  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.958299  hitchhiker  0.000003014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2410  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 601 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 624 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 627 aa  100  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1497  ABC transporter periplamic substrate-binding protein  21.98 
 
 		 602 aa  100  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  24.34 
 
 		 611 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 611 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  22.22 
 
 		 602 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 		 650 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3534  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 626 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.173833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 661 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  23.99 
 
 		 609 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 		 686 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4213  extracellular solute-binding protein family 5  21.59 
 
 		 621 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.238618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 646 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.01 
 
 		 650 aa  99.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 590 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  21.22 
 
 		 621 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0010  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.36 
 
 		 610 aa  99.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.113788  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7055  oligopeptide ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  21.91 
 
 		 614 aa  99.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0391894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2359  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 645 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0844875  normal  0.182874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0526  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 643 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241638  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1978  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.83 
 
 		 686 aa  98.2  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00175999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29650  oligopeptide ABC transporter, periplasmic substrate binding protein  21.96 
 
 		 613 aa  98.2  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000703906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  21.17 
 
 		 622 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2711  ABC transporter, periplamic substrate-binding protein  21.79 
 
 		 602 aa  98.2  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 597 aa  97.8  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0704  ABC peptide transporter, substrate binding protein  22.96 
 
 		 645 aa  97.4  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1173  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  22.24 
 
 		 625 aa  97.1  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000592479  normal  0.415148 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  23.35 
 
 		 622 aa  97.1  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  21.47 
 
 		 654 aa  97.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3366  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 619 aa  97.1  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.68 
 
 		 575 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 627 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1946  extracellular solute-binding protein  22.9 
 
 		 611 aa  97.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.185407  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 615 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0597  extracellular solute-binding protein  23.14 
 
 		 633 aa  96.7  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1344  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 638 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.439366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  23.19 
 
 		 602 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0342  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 637 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5371  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.39 
 
 		 623 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 609 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2552  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 616 aa  95.9  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.437338  normal  0.0565568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0379  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 628 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 559 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0289  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 632 aa  94.7  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  25.13 
 
 		 566 aa  95.1  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0387  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 		 637 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.651599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  22.12 
 
 		 631 aa  94.4  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2773  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 600 aa  94.4  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>