More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12607 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12607  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 573 aa  1142    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.455392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15100  protein-export membrane protein SecD  50.83 
 
 		 603 aa  575  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2304  protein-export membrane protein SecD  58.21 
 
 		 550 aa  568  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2583  preprotein translocase subunit SecD  79.83 
 
 		 599 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.321622  normal  0.917688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  80.66 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  80.66 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  80.66 
 
 		 598 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  55.23 
 
 		 538 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  75.82 
 
 		 617 aa  524  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  50.72 
 
 		 632 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  48.29 
 
 		 566 aa  430  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6109  Preprotein translocase subunit SecD-like protein  43.86 
 
 		 581 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  42.63 
 
 		 584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17550  protein-export membrane protein SecD  39.39 
 
 		 714 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.122587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1373  preprotein translocase subunit SecD  40.96 
 
 		 607 aa  355  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  39.18 
 
 		 670 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3391  protein-export membrane protein SecD  59.26 
 
 		 649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000226578  hitchhiker  0.0000733205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1366  protein-export membrane protein SecD  37.84 
 
 		 620 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.25927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  37.61 
 
 		 661 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2299  preprotein translocase subunit SecD  36.32 
 
 		 585 aa  309  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1798  protein-export membrane protein SecD  37.01 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.427171  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1341  preprotein translocase subunit SecD  53.54 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.022847  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12860  protein-export membrane protein SecD  38.72 
 
 		 620 aa  297  3e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.258671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2061  protein-export membrane protein SecD  40.76 
 
 		 547 aa  289  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.789489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2389  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5142  preprotein translocase subunit SecD  42.46 
 
 		 680 aa  288  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.75892  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3824  protein-export membrane protein SecD  50 
 
 		 656 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2029  preprotein translocase subunit SecD  36.3 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000877869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1670  protein-export membrane protein SecD  42.46 
 
 		 635 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15310  protein-export membrane protein SecD  34.56 
 
 		 640 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.540675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2356  protein-export membrane protein SecD  44.28 
 
 		 674 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1812  protein-export membrane protein SecD  46.65 
 
 		 666 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.279659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1802  protein-export membrane protein SecD  45.65 
 
 		 653 aa  260  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.414477  decreased coverage  0.00000714928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3051  protein-export membrane protein SecD  45.54 
 
 		 684 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0945  protein-export membrane protein SecD  41.67 
 
 		 496 aa  206  8e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  38.08 
 
 		 533 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  38.38 
 
 		 533 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  37.67 
 
 		 534 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  38.63 
 
 		 533 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  38.43 
 
 		 533 aa  179  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  37.72 
 
 		 532 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  37.58 
 
 		 533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  33.07 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  36.03 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.49 
 
 		 531 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09291  preprotein translocase subunit SecD  29.2 
 
 		 487 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.07 
 
 		 995 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  33.02 
 
 		 410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  35.09 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  35.09 
 
 		 594 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  36.62 
 
 		 735 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000114723  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  34.2 
 
 		 535 aa  165  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  27.77 
 
 		 848 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09311  preprotein translocase subunit SecD  27.64 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.483137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.4 
 
 		 853 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.02 
 
 		 849 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.1 
 
 		 532 aa  163  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0984  protein-export membrane protein SecD  37.7 
 
 		 900 aa  163  8.000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.583326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  36.73 
 
 		 530 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  38.13 
 
 		 856 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0904  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 445 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000019832  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4072  protein-export membrane protein SecD  26.72 
 
 		 885 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  37.5 
 
 		 531 aa  161  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  32.78 
 
 		 556 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  34.8 
 
 		 554 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  35.24 
 
 		 761 aa  161  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  38.2 
 
 		 530 aa  161  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  30.66 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3183  protein-export membrane protein SecD  35.56 
 
 		 989 aa  160  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0406791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  33.22 
 
 		 403 aa  160  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  38.01 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.81 
 
 		 1029 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 533 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1334  protein-export membrane protein SecD  33.44 
 
 		 487 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.763605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  37.88 
 
 		 532 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1691  protein-export membrane protein SecD  34.25 
 
 		 461 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0199339  normal  0.405053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  35.84 
 
 		 531 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1191  preprotein translocase subunit SecD  36.07 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.56 
 
 		 856 aa  155  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  38.26 
 
 		 622 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10121  preprotein translocase subunit SecD  27.65 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  37.26 
 
 		 533 aa  154  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07200  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  36.91 
 
 		 855 aa  154  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  35.46 
 
 		 525 aa  154  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  33.1 
 
 		 554 aa  153  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1669  preprotein translocase subunit SecD  31.46 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000293049  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0870  preprotein translocase subunit SecD  27.69 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  37.76 
 
 		 535 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12600  protein-export membrane protein SecF/protein-export membrane protein SecD  34 
 
 		 977 aa  152  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  31.03 
 
 		 416 aa  151  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1490  preprotein translocase subunit SecD  32.45 
 
 		 474 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1279  preprotein translocase subunit SecD  29.44 
 
 		 495 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.221382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  34.83 
 
 		 537 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  34.89 
 
 		 530 aa  150  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5077  preprotein translocase subunit SecD  31.44 
 
 		 461 aa  150  8e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  30.06 
 
 		 638 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1116  protein-export membrane protein SecD  34.12 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.887298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  36.72 
 
 		 534 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>