More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2069 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  100 
 
 		 410 aa  819    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  58.98 
 
 		 407 aa  497  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  56.17 
 
 		 407 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  56.48 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  57.32 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  57.32 
 
 		 404 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  52.68 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00171  pili biogenesis protein  51.05 
 
 		 426 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  51.71 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  38.93 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  41.08 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  40.92 
 
 		 406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  39.17 
 
 		 405 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  38.93 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  37.11 
 
 		 406 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  41.87 
 
 		 406 aa  308  9e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  40.15 
 
 		 409 aa  305  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  41.26 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  40.05 
 
 		 408 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  39.9 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  44.41 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  36.71 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  38.5 
 
 		 405 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  38.88 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  40.93 
 
 		 409 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  36.96 
 
 		 407 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  36.43 
 
 		 419 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  37.68 
 
 		 411 aa  289  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  37.78 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  38.92 
 
 		 406 aa  287  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  37.62 
 
 		 417 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  37.9 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  37.28 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2142  type II secretion system protein  36.86 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0354555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  42.68 
 
 		 403 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  35.45 
 
 		 403 aa  279  5e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  37.25 
 
 		 416 aa  279  7e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06891  Type II secretory pathway component PulF-like protein  40.17 
 
 		 453 aa  279  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.807158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  36.88 
 
 		 419 aa  279  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2369  type IV pilus assembly protein PilC  35.82 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.529559  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  39.51 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0508  pilus tip-associated protein  36.59 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.139168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3920  type II secretion system protein  37.12 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128223  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4448  type IV pilus biogenesis protein PilC  35.57 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.04892  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1187  Type II secretory pathway component PulF-like  41.45 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.497537  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  35.63 
 
 		 422 aa  274  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0767  type II secretion system protein  34.84 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  36.3 
 
 		 403 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0804  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 405 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  41.79 
 
 		 403 aa  272  7e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3868  type II secretion system protein  38.48 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000419174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  35.39 
 
 		 419 aa  270  2.9999999999999997e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0549  type II secretion system protein  36.39 
 
 		 408 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  35.57 
 
 		 419 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3920  type II secretion system protein  38.4 
 
 		 422 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0412  type II secretion system protein  38.48 
 
 		 422 aa  269  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3439  type II secretion system protein  38.08 
 
 		 422 aa  269  8e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  39.77 
 
 		 404 aa  268  8.999999999999999e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4221  type II secretion system protein  34.91 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0312  type II secretion system protein  36.97 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.37 
 
 		 401 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0681  type II secretion system protein  39 
 
 		 407 aa  266  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  37.87 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0992  type II secretion system protein  37.41 
 
 		 433 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0638  type II secretion system protein  37.43 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00492015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03232  type IV pilus biogenesis protein PilC  36.54 
 
 		 402 aa  264  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.169969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  35.35 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0415  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.75 
 
 		 423 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2108  fimbrial assembly protein  35.14 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2030  type II secretion system protein  35.14 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.419764  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  34.85 
 
 		 405 aa  262  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0368  type IV pilus biogenesis protein PilC  37.78 
 
 		 419 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206315  unclonable  0.00000947643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3943  type II secretion system protein  38.08 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0925  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.59 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0767  type II secretion system protein  35.59 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.336248  normal  0.146084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1174  type II secretion system protein  37.13 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.394888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  35.1 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2706  type II secretion system protein  34.51 
 
 		 420 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0786  type IV pilin biogenesis protein PilC  35.1 
 
 		 403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.447941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3071  type II secretion system protein  34.51 
 
 		 424 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5163  pilin biogenesis protein  37.12 
 
 		 405 aa  259  7e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  34.31 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0797  type II secretion system protein  33.08 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  35.85 
 
 		 403 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2826  fimbrial assembly transmembrane protein  33.67 
 
 		 421 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198516  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3255  type II secretion system protein  36.03 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3784  type II secretion system protein  38.48 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0842  type II secretion system protein  35.09 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0345915  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1480  pilus assembly protein PilC  34.64 
 
 		 406 aa  255  8e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2095  type IV pilin biogenesis protein PilC  36.45 
 
 		 404 aa  255  9e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0774  type II secretion system protein  35.77 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4061  type II secretion system protein  37.84 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.16247  normal  0.505472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  35.98 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2961  type II secretion system protein  34.51 
 
 		 424 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  34.79 
 
 		 404 aa  254  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1503  pilus assembly protein PilC  34.4 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>