159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3063 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  100 
 
 		 333 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  66.37 
 
 		 337 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  45.65 
 
 		 334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  43.82 
 
 		 336 aa  281  9e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  37.5 
 
 		 340 aa  216  5.9999999999999996e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  37.09 
 
 		 349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  37.57 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  34.33 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4320  amidohydrolase 2  35.5 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.648445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  35.59 
 
 		 342 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  35.01 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3208  amidohydrolase 2  34.72 
 
 		 342 aa  198  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  36.07 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  34.81 
 
 		 341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3943  amidohydrolase 2  35.5 
 
 		 335 aa  195  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0338  amidohydrolase 2  34.51 
 
 		 342 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  36.09 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0168  amidohydrolase 2  35.69 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  35.38 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  34.42 
 
 		 342 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  34.51 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2032  amidohydrolase 2  35.1 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  34.12 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3632  amidohydrolase 2  34.22 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.784005 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6375  amidohydrolase 2  33.14 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00192983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4449  amidohydrolase 2  31.86 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.163224  normal  0.0432187 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6039  amidohydrolase 2  35.21 
 
 		 341 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0698551  normal  0.185903 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7570  amidohydrolase 2  34.12 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142682  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4376  amidohydrolase 2  31.56 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3361  amidohydrolase 2  32.65 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  31.58 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25.96 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.98 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  28.72 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  33.06 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  25.25 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  25.66 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  27.43 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  26.59 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  30.93 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  26.97 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.8 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  29.67 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  26.7 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  29.91 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  26.49 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  26.17 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  26.35 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  26.47 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.9 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  28.22 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  27.87 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  27.86 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  24.75 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  25 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  26.52 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  25 
 
 		 334 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  25.09 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.36 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  25.98 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.42 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  26.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  24.74 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  26.27 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  31.13 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.92 
 
 		 346 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  25.34 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  25.17 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  25.62 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1472  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.45 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  25.22 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  27.23 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  22.61 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.27 
 
 		 629 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  24.18 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  23.38 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  23.56 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  25.16 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  27.88 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  26.36 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  23.57 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.08 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  24.82 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  31.18 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  26.23 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  26.5 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.97 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.88 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.6 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  26 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  24.88 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2759  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.82576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  33.86 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  24.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  26.29 
 
 		 391 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>