More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0096 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0096  NLP/P60 protein  100 
 
 		 312 aa  617  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.7705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0712  cell wall-associated hydrolase  50 
 
 		 306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.507156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3528  NLP/P60  47.29 
 
 		 283 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4311  NLP/P60 protein  42.81 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.201596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1776  NLP/P60  43.66 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.390211  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3721  NLP/P60  44.91 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4584  NLP/P60 protein  44.36 
 
 		 276 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0858  NLP/P60 protein  40.86 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0257977  normal  0.028426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0817  NLP/P60 protein  40.5 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.391542  normal  0.198058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3041  NLP/P60 protein  41.26 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.241785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4208  NLP/P60 protein  43.61 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.200815  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1116  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.19125  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0280  NLP/P60 protein  43.18 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.273042  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1265  NLP/P60 family protein  35.97 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0430  NLP/P60 protein  42.28 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0782  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0488091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3361  NLP/P60 protein  42.14 
 
 		 288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0297  hypothetical protein  38.43 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.633779  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0105  NLP/P60  38.63 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0293  cell wall-associated hydrolase  42.86 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7040  NLP/P60 family protein  40.43 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.732055 
 
 
-
 
NC_004310  BR2179  NLP/P60 family protein  39.58 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266984  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2091  NLP/P60 family protein  39.58 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0383  NLP/P60  42.32 
 
 		 281 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1127  NLP/P60 protein  39.01 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.111374 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0732  NLP/P60 protein  36.04 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4198  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3951  NLP/P60  38.35 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.613547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2154  NLP/P60 protein  42.29 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  0.749613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0244  NLP/P60 protein  39.1 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4487  NLP/P60 protein  37.14 
 
 		 285 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3233  NLP/P60 protein  44.34 
 
 		 279 aa  159  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.534878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0039  NLP/P60 protein  38.77 
 
 		 270 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1380  hypothetical protein  38.77 
 
 		 271 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0048  NLP/P60 protein  38.41 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0780825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3454  NLP/P60  38.74 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2708  NLP/P60 protein  39.65 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1111  NLP/P60  37.96 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00228978  hitchhiker  0.00442968 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  28.95 
 
 		 250 aa  90.9  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3657  NLP/P60 protein  40.16 
 
 		 385 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1954  lipoprotein; cell wall-associated hydrolase  32 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370488  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4057  NLP/P60  27.5 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144265  normal  0.145245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3592  NLP/P60 protein  28.02 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4613  NLP/P60 protein  29.82 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000101547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11858  dipeptidyl peptidase VI  27.09 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.706852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2224  NLP/P60  29.32 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.231098  hitchhiker  0.0000179311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2413  NLP/P60  23.08 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000144369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  37.96 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31170  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.91 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.000817725  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  36.84 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3201  NLP/P60 protein  29.68 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234486  normal  0.143067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  33.59 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  36.59 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1113  hypothetical protein  39.22 
 
 		 141 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.934935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.25 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.77 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  36.52 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 346 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  30.08 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.67 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01906  outer membrane lipoprotein  38.61 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.211693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  40.45 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  25.38 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  29.14 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  38.46 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  25.38 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  40.96 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  35.34 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  29.14 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  29.14 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  29.14 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  29.55 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  35.05 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  30.81 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.05 
 
 		 556 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  36.17 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  34.48 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  31.01 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  40.51 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  26.29 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  34.62 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  34.78 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  36.19 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  37.11 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  37.07 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  34.34 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  40.4 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  39.32 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  37.08 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  30.89 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  25 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>