More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2316 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
1116 aa  2239    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  54.98 
 
 
739 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0770  translation initiation factor IF-2  63.52 
 
 
894 aa  912    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  52.58 
 
 
903 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  45.61 
 
 
971 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2774  translation initiation factor IF-2  37.94 
 
 
1131 aa  675    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0650084  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  41.85 
 
 
1029 aa  673    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  44.96 
 
 
882 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  38.94 
 
 
1161 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  38.38 
 
 
985 aa  702    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.89 
 
 
692 aa  634  1e-180  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 
732 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  47.86 
 
 
980 aa  622  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 
883 aa  621  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 
884 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  51.46 
 
 
986 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
882 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.95 
 
 
822 aa  608  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0831  translation initiation factor IF-2  42.29 
 
 
882 aa  600  1e-170  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.857351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  52.73 
 
 
720 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 
949 aa  598  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0814  translation initiation factor IF-2  46.23 
 
 
882 aa  598  1e-169  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0318288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  46.85 
 
 
921 aa  598  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
888 aa  593  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  44.27 
 
 
860 aa  595  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0381  translation initiation factor IF-2  51.74 
 
 
927 aa  590  1e-167  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07840  translation initiation factor IF-2  51.11 
 
 
686 aa  591  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 
947 aa  591  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0699  translation initiation factor IF-2  42.65 
 
 
752 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000680705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
688 aa  587  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 
845 aa  588  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 
689 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0991  translation initiation factor 2  52.95 
 
 
1035 aa  589  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0315386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  48.48 
 
 
686 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  48.69 
 
 
686 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  48.69 
 
 
686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  48.69 
 
 
686 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1329  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
705 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1355  translation initiation factor IF-2  51.97 
 
 
705 aa  583  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657841  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  49.39 
 
 
997 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0383  translation initiation factor IF-2  51.21 
 
 
943 aa  586  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
879 aa  582  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0609  translation initiation factor IF-2  49.65 
 
 
711 aa  580  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000891187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 
686 aa  582  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 
686 aa  582  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 
688 aa  582  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 
920 aa  579  1e-164  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  47.63 
 
 
915 aa  580  1e-164  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  48.54 
 
 
686 aa  582  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  42.48 
 
 
1079 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1940  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.995818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  50.78 
 
 
1079 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1658  translation initiation factor IF-2  49.57 
 
 
679 aa  572  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  50.09 
 
 
924 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  46.47 
 
 
1011 aa  567  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  48.89 
 
 
885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3930  translation initiation factor IF-2  45.3 
 
 
856 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  48.5 
 
 
936 aa  565  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  51.13 
 
 
896 aa  560  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  48.7 
 
 
892 aa  561  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  50.26 
 
 
940 aa  562  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  48.97 
 
 
774 aa  562  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1355  translation initiation factor IF-2  46.02 
 
 
834 aa  562  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.723459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  49.34 
 
 
962 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  47.67 
 
 
952 aa  561  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 
894 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  43.18 
 
 
964 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  49.39 
 
 
984 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  48.38 
 
 
896 aa  557  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0570  translation initiation factor IF-2  55.56 
 
 
928 aa  559  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0817  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 
950 aa  557  1e-157  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  47.17 
 
 
991 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1012  translation initiation factor IF-2  49.56 
 
 
854 aa  556  1e-156  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000897592  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2165  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 
959 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.34369  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3441  translation initiation factor IF-2  43.15 
 
 
885 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1462  translation initiation factor IF-2  48.69 
 
 
1022 aa  554  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.887341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0169  translation initiation factor IF-2  42.79 
 
 
926 aa  554  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  48.38 
 
 
895 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1444  translation initiation factor 2 (bIF-2)  49.66 
 
 
673 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000295252  normal  0.305972 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 
881 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  48.63 
 
 
898 aa  552  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  47.88 
 
 
896 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1261  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 
945 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.55 
 
 
884 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  48.04 
 
 
894 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1411  translation initiation factor 2  50.43 
 
 
689 aa  550  1e-155  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2077  translation initiation factor IF-2  45.04 
 
 
990 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3976  translation initiation factor 2  47.96 
 
 
1059 aa  550  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  45.16 
 
 
1058 aa  551  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.06 
 
 
902 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1495  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 
885 aa  549  1e-154  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0130747  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl295  translation initiation factor IF-2  48.72 
 
 
629 aa  546  1e-154  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000364465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  48.04 
 
 
891 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2091  translation initiation factor IF-2  48.46 
 
 
1005 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.596015  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0599  translation initiation factor IF-2  48.79 
 
 
1042 aa  547  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  47.25 
 
 
911 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0398  translation initiation factor IF-2  47.64 
 
 
986 aa  548  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0010836  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0433  translation initiation factor IF-2  47.15 
 
 
829 aa  549  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3221  translation initiation factor IF-2  47.23 
 
 
815 aa  547  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.109257 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  47.68 
 
 
975 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>