104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7182 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7182  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.0722414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4561  hypothetical protein  85.12 
 
 		 311 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0028561  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19640  site-specific recombinase XerD  47.99 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0211169  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4226  RNA polymerase sigma factor containing a TPR repeat domain-like protein  41.6 
 
 		 680 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0869  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  42.2 
 
 		 651 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456252  normal  0.192635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5207  hypothetical protein  37.29 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284913  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  28.47 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  25.91 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  28.83 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  25 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  22.94 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  30.25 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  30.15 
 
 		 390 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  24.57 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  22.01 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.41 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  28.37 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  28.37 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  26.42 
 
 		 301 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  23.95 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3097  site-specific recombinase XerD-like protein  32.26 
 
 		 205 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  27.88 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  27.37 
 
 		 295 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  27.84 
 
 		 284 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  29.07 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.58 
 
 		 295 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1322  integrase family protein  26.81 
 
 		 329 aa  48.9  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86275  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  22.3 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.35 
 
 		 292 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 362 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  24 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  22.74 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  25.43 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  24 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  24 
 
 		 399 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.51 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  25.25 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.07 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  24 
 
 		 399 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30.14 
 
 		 313 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.49 
 
 		 317 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  25.77 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0004  phage integrase family site specific recombinase  25.4 
 
 		 336 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.11 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1239  phage integrase  25.93 
 
 		 419 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.183742 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  22.22 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.57 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.66 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  24.67 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.32 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  25.82 
 
 		 349 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4666  hypothetical protein  39.13 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  24.71 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  23.56 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  23.56 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.89 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  23.56 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.72 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  27.71 
 
 		 325 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.17 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0586  site-specific recombinase, phage integrase family  23.92 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  21.64 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.14 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  32.37 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.54 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.42 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  24.26 
 
 		 417 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  27.96 
 
 		 373 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  29.1 
 
 		 332 aa  43.5  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  31.58 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  27.54 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  35.53 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  25.75 
 
 		 291 aa  43.1  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.19 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  31.17 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  32.6 
 
 		 313 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  26.57 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  28.57 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  23.86 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.96 
 
 		 318 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  24.66 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1015  integrase/recombinase XerC, putative  23.92 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  23.43 
 
 		 285 aa  42.7  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5501  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.23 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  27.88 
 
 		 324 aa  42.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  24.71 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  29.95 
 
 		 295 aa  42.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  25.17 
 
 		 343 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>