More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6012 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 317 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  75.08 
 
 		 317 aa  463  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  66.46 
 
 		 321 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  68.26 
 
 		 325 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  64.33 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  71.09 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  61.11 
 
 		 314 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 		 307 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  54.49 
 
 		 326 aa  332  5e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  55.48 
 
 		 304 aa  331  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  55.78 
 
 		 312 aa  328  9e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 341 aa  320  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 		 317 aa  318  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  59.38 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  54.26 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  55.05 
 
 		 289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  55.94 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  53.21 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  54.9 
 
 		 326 aa  299  4e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  54.71 
 
 		 313 aa  298  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  53.35 
 
 		 328 aa  296  4e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  54.87 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  55.41 
 
 		 313 aa  291  7e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 308 aa  289  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  55.25 
 
 		 339 aa  286  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  53.77 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  53.02 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  54.64 
 
 		 294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 333 aa  285  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  55.94 
 
 		 313 aa  285  8e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  51.42 
 
 		 332 aa  276  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  52.46 
 
 		 315 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  49.68 
 
 		 319 aa  271  9e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 306 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 		 317 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.67 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.88 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 622 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  41.82 
 
 		 312 aa  199  7e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  46.58 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 		 535 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  38.61 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 		 472 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.33 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 534 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  36.16 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 312 aa  186  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  34.7 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  39.34 
 
 		 309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  38.54 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 		 321 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 483 aa  182  9.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  39.74 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 		 443 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  42.74 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.14 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  40.26 
 
 		 624 aa  177  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  41.06 
 
 		 313 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  40.26 
 
 		 304 aa  176  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  39.24 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 295 aa  176  6e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  39.94 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  45.29 
 
 		 317 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  43.07 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  38.36 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  38.36 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.93 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  35.53 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.14 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 		 310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  34.65 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  44.49 
 
 		 297 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  42.57 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  37.29 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 495 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  37.04 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  36.67 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>