More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1711 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 297 aa  570  1e-161  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 304 aa  271  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  48.99 
 
 		 317 aa  268  5.9999999999999995e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  52.49 
 
 		 339 aa  268  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  54.36 
 
 		 294 aa  267  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  51.42 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  51.55 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  48.81 
 
 		 312 aa  258  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 		 326 aa  257  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  51.05 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  50.52 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  53.74 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  50.69 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  50.88 
 
 		 342 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  51.61 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  51.07 
 
 		 328 aa  247  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 306 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  52.5 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  48.77 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 		 341 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  49.45 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  51.74 
 
 		 307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  49.29 
 
 		 296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 		 294 aa  239  5.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 342 aa  236  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  47.39 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  48.28 
 
 		 622 aa  236  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 		 314 aa  234  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  44.1 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44.1 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  47.57 
 
 		 332 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  49.31 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  47.18 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  46.45 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  47.2 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.93 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  47.2 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  48.23 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.96 
 
 		 535 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  47.2 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  47.86 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  46.1 
 
 		 534 aa  220  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 		 443 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  44.29 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  43.28 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 		 316 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  45.23 
 
 		 306 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 		 302 aa  208  9e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.02 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  48.4 
 
 		 624 aa  207  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.6 
 
 		 296 aa  205  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.72 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  41.28 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.28 
 
 		 312 aa  203  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  45.05 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.45 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  46.07 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  42.25 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  38.24 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  43.37 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  41.32 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.01 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  36.43 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  43.1 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  44.15 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  41.94 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  40.65 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 325 aa  192  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  41.84 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  41.79 
 
 		 311 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.91 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  44.2 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  42.75 
 
 		 345 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 		 297 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  189  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  43.11 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>