More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1042 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 325 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  72.78 
 
 		 316 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  71.84 
 
 		 316 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  70.65 
 
 		 316 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  61.67 
 
 		 312 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  61.67 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  61.22 
 
 		 315 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  65.51 
 
 		 310 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  59.72 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 		 321 aa  332  4e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  54.19 
 
 		 315 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  57.39 
 
 		 309 aa  324  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  57.53 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  54.15 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  55.82 
 
 		 311 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  57.48 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  57.04 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  60.22 
 
 		 317 aa  316  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  60.22 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  54.93 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  53.22 
 
 		 353 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  54.61 
 
 		 313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  57.04 
 
 		 308 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  55.8 
 
 		 312 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  58.24 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  52.68 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  52.68 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  57.62 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  59.34 
 
 		 317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  53.98 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  53.98 
 
 		 310 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  55.71 
 
 		 310 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  54.71 
 
 		 313 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  53.97 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  50.88 
 
 		 295 aa  293  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  53.36 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  52.58 
 
 		 316 aa  291  1e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  54.66 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  53.96 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  53.98 
 
 		 313 aa  288  8e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  55.83 
 
 		 302 aa  281  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  54.28 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  54.85 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 295 aa  262  6e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  46.64 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.06 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  43.93 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 317 aa  209  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  41.86 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 		 535 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.25 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 534 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  39.33 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  38.16 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  37.68 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  41.87 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.97 
 
 		 622 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  41.31 
 
 		 301 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  38.95 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 306 aa  193  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 302 aa  192  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 305 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>