More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0713 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 301 aa  591  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  99.67 
 
 		 301 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  83.89 
 
 		 300 aa  484  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  79.86 
 
 		 297 aa  457  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  57.93 
 
 		 302 aa  295  7e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  53.74 
 
 		 301 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  54.08 
 
 		 301 aa  288  9e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 301 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  56.21 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  57.39 
 
 		 305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 305 aa  282  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  54.14 
 
 		 312 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 		 300 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  56.9 
 
 		 306 aa  282  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 		 313 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 		 305 aa  279  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  53.63 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  51.72 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  55.02 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  53.4 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 		 310 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  50.51 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  50.51 
 
 		 306 aa  275  7e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  55.25 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  53.79 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  53.74 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  48.8 
 
 		 304 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 301 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  52.41 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  53.47 
 
 		 302 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 		 301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  53.06 
 
 		 298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  52.58 
 
 		 311 aa  268  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  53.45 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  54.48 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 298 aa  263  4e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 		 299 aa  262  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  56.7 
 
 		 297 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  53.45 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  53.26 
 
 		 304 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  55.33 
 
 		 296 aa  257  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 304 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  50.52 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  53.12 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  53.12 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  49.14 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  54.17 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  53.42 
 
 		 298 aa  248  8e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  55.11 
 
 		 297 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  55.25 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  54.87 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  54.87 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  47.08 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  54.7 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  55.33 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  53.29 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  44.59 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  45.89 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  45.67 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  45.89 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44.83 
 
 		 317 aa  210  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  44.18 
 
 		 315 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>