More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4646 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 315 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  70.07 
 
 		 313 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  69.86 
 
 		 312 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  69.79 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  66.32 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  70.33 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  70.33 
 
 		 328 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  69.89 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  69.89 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  66.88 
 
 		 313 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  66.67 
 
 		 312 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  61.35 
 
 		 316 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  59.58 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  60.27 
 
 		 316 aa  345  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  59.11 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  59.11 
 
 		 312 aa  345  6e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  64.81 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  60.13 
 
 		 316 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  57.04 
 
 		 325 aa  334  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  59.23 
 
 		 310 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 		 310 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  60.53 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  60.2 
 
 		 317 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  60.2 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  61.81 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  57.05 
 
 		 309 aa  321  9.999999999999999e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  63.21 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  60.07 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  57.01 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  57.99 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  54.9 
 
 		 315 aa  312  5.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 		 310 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  56.31 
 
 		 313 aa  302  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  57.05 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  56.83 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  50.36 
 
 		 295 aa  294  2e-78  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  54.79 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  56.85 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  55.32 
 
 		 308 aa  289  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  53.82 
 
 		 311 aa  287  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  50.88 
 
 		 302 aa  272  6e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 		 295 aa  268  1e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  46.27 
 
 		 295 aa  261  1e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  45.49 
 
 		 534 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  45.77 
 
 		 299 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 302 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 		 535 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 323 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  46.74 
 
 		 328 aa  218  7e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  47.12 
 
 		 302 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  45.89 
 
 		 443 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  45.52 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  46.69 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.24 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  48.75 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  48.04 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 317 aa  210  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  47.14 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  46.98 
 
 		 296 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  44.17 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  46.29 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  45.8 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  45.04 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.46 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  45.99 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  46.59 
 
 		 300 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  47.08 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  46.59 
 
 		 300 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  43.66 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  46.24 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  46.24 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  46.24 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  46.24 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  44.26 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 		 294 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  46.24 
 
 		 310 aa  201  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 300 aa  201  9e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  45.69 
 
 		 622 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>