More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3688 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
323 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  77.27 
 
 
323 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  77.6 
 
 
323 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  69.09 
 
 
317 aa  447  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  71.43 
 
 
318 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  64.78 
 
 
328 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  62.15 
 
 
324 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  57.41 
 
 
276 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  47.35 
 
 
535 aa  244  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  49.64 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  46.5 
 
 
304 aa  243  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  47.22 
 
 
622 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  47.7 
 
 
534 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 
326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  46.34 
 
 
312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  44.72 
 
 
289 aa  231  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  43.19 
 
 
328 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  43.29 
 
 
314 aa  227  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.36 
 
 
318 aa  225  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  47.06 
 
 
313 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  44.64 
 
 
313 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 
308 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  43.54 
 
 
317 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 
312 aa  222  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 
315 aa  222  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 
335 aa  220  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 
333 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 
333 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  43.92 
 
 
339 aa  219  5e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 
293 aa  217  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  40.74 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
312 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 
624 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  40.33 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
303 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  43.62 
 
 
341 aa  212  9e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 
306 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 
307 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
326 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  44.95 
 
 
294 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
317 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  47.18 
 
 
443 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 
316 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
316 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
297 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
317 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.32 
 
 
315 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  40.74 
 
 
321 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
301 aa  207  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 
302 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
297 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 
309 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 
328 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 
321 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
295 aa  205  7e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  43.12 
 
 
300 aa  205  8e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 
315 aa  205  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  43.12 
 
 
300 aa  204  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  43.12 
 
 
300 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  43.43 
 
 
311 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
306 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  43.12 
 
 
300 aa  203  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  39.5 
 
 
301 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  44.13 
 
 
309 aa  202  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  41.39 
 
 
325 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 
299 aa  202  8e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 
302 aa  202  8e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  44.24 
 
 
299 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  41.01 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  41.07 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  41.01 
 
 
305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 
301 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06451  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 
333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  46.92 
 
 
586 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 
316 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  41.39 
 
 
302 aa  199  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  42.29 
 
 
308 aa  199  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 
303 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 
316 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 
301 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  42.38 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>