More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2461 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
333 aa  666    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
333 aa  666    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  99.68 
 
 
310 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  79.8 
 
 
308 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  83.82 
 
 
313 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  83.5 
 
 
313 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  69.05 
 
 
328 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  66.23 
 
 
335 aa  398  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  62.07 
 
 
326 aa  392  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 
307 aa  378  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  51.18 
 
 
312 aa  296  3e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  53.55 
 
 
289 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  55.76 
 
 
313 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 
317 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  50.65 
 
 
321 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  52.72 
 
 
294 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  53.5 
 
 
341 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  51.4 
 
 
317 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 
314 aa  278  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  53.74 
 
 
307 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  52.1 
 
 
328 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 
317 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  48.83 
 
 
304 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  49.17 
 
 
326 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 
293 aa  269  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 
315 aa  268  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 
319 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  47.55 
 
 
342 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 
306 aa  261  8.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.03 
 
 
325 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  49.02 
 
 
332 aa  259  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  51.71 
 
 
294 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 
328 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  45.24 
 
 
342 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.18 
 
 
317 aa  247  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  48.14 
 
 
339 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  45.61 
 
 
323 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  45.61 
 
 
323 aa  229  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 
318 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  43.65 
 
 
622 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  45.83 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
324 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  45.21 
 
 
312 aa  209  4e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.24 
 
 
328 aa  209  8e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.8 
 
 
302 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  41.85 
 
 
482 aa  205  9e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  47.2 
 
 
297 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
534 aa  202  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 
535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  47.02 
 
 
624 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 
483 aa  194  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 
495 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  40.42 
 
 
318 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
315 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 
317 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 
313 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 
316 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 
472 aa  186  7e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  43.19 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  44.63 
 
 
586 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.68 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 
478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  39.46 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 
328 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 
328 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 
353 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  40.39 
 
 
313 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
308 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.64 
 
 
315 aa  182  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  42.15 
 
 
312 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 
309 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 
443 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.94 
 
 
300 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  37.65 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  39.65 
 
 
311 aa  179  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 
300 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 
300 aa  178  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.74 
 
 
315 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.74 
 
 
312 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 
276 aa  178  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 
300 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  39.54 
 
 
310 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.12 
 
 
301 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
301 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  43.84 
 
 
452 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
300 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
300 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
300 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>