More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3708 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
443 aa  882    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  53.92 
 
 
535 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  53.61 
 
 
534 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  52.25 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  48.94 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  48.59 
 
 
323 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  45.93 
 
 
315 aa  238  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  49.01 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  46.34 
 
 
622 aa  235  9e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  48.24 
 
 
317 aa  235  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  46.51 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  47.1 
 
 
318 aa  231  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  44.92 
 
 
315 aa  230  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  46.58 
 
 
315 aa  230  4e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  46.58 
 
 
312 aa  230  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  42.41 
 
 
295 aa  227  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  43.09 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 
326 aa  226  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  45.82 
 
 
296 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  45.89 
 
 
315 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  45.39 
 
 
313 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  47.59 
 
 
318 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 
312 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  47.02 
 
 
328 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 
302 aa  220  3e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
289 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  46.64 
 
 
312 aa  219  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 
313 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  44.63 
 
 
313 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  45.57 
 
 
624 aa  217  4e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  42.09 
 
 
316 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  45.17 
 
 
303 aa  216  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 
310 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.69 
 
 
316 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  45.52 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  43.39 
 
 
328 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  43.39 
 
 
328 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  43.52 
 
 
316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 
300 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  41.14 
 
 
307 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  41.04 
 
 
305 aa  214  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  44.77 
 
 
314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  48.68 
 
 
586 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.37 
 
 
316 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
312 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  44.59 
 
 
297 aa  210  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  45.58 
 
 
301 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  45.58 
 
 
301 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  46.21 
 
 
296 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.37 
 
 
325 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  42.23 
 
 
293 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  46.6 
 
 
321 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  44.78 
 
 
317 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 
299 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 
304 aa  207  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  40.72 
 
 
312 aa  204  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  43.53 
 
 
316 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  45.49 
 
 
294 aa  203  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 
307 aa  203  6e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 
310 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 
308 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 
310 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  46.72 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  43.54 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 
317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  47.7 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 
295 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  41.12 
 
 
304 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  45.05 
 
 
298 aa  199  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  41.88 
 
 
300 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  43.09 
 
 
309 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  40.98 
 
 
317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 
300 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  43.58 
 
 
300 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 
312 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 
301 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 
317 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.56 
 
 
300 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  43.1 
 
 
313 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 
301 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  42.09 
 
 
313 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  40.84 
 
 
302 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.39 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 
301 aa  196  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 
317 aa  196  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 
313 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  41.97 
 
 
301 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>