More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0408 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  64.26 
 
 		 296 aa  342  5e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  61.06 
 
 		 624 aa  317  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  48.77 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  49.13 
 
 		 534 aa  239  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  49.47 
 
 		 318 aa  238  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.61 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.28 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 622 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  47.37 
 
 		 535 aa  228  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  46.34 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  45.1 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.27 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  48.5 
 
 		 586 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  44.72 
 
 		 315 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  43.29 
 
 		 328 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  44.25 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  44.01 
 
 		 319 aa  208  9e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.3 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 		 312 aa  208  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  45.03 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  39.61 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 333 aa  206  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 310 aa  205  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 301 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  43.69 
 
 		 317 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.56 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  43.98 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  43.8 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  43.84 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  44.18 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  46.85 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  46.85 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  45.7 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.52 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  41.95 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  41.95 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  41.64 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.59 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.59 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  39.59 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 		 325 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 		 289 aa  198  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  44.18 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  41.91 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  43.15 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  38.39 
 
 		 310 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  46.46 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  43.78 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  43.78 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  43.48 
 
 		 342 aa  195  9e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>