More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0270 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 312 aa  623  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  90.71 
 
 		 311 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  83.01 
 
 		 313 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  83.01 
 
 		 313 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  80.86 
 
 		 310 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  77.22 
 
 		 301 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  74.67 
 
 		 301 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  74.41 
 
 		 300 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  75.08 
 
 		 300 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  74.75 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  74.07 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  74.07 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  74.07 
 
 		 300 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  75.44 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  75.44 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  75.44 
 
 		 300 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  75.44 
 
 		 300 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  75.09 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  75.09 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  75.09 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  74.5 
 
 		 301 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  75.09 
 
 		 300 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  73.4 
 
 		 300 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  72.2 
 
 		 297 aa  431  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  71.19 
 
 		 297 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  65.25 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  65.25 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  66.78 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  62.5 
 
 		 301 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  61.26 
 
 		 304 aa  364  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  64.54 
 
 		 302 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  62.9 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  60.78 
 
 		 306 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  61.84 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  61.06 
 
 		 300 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  64.66 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  61.37 
 
 		 298 aa  328  9e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  63.12 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  61.05 
 
 		 306 aa  316  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  54.64 
 
 		 299 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  54.8 
 
 		 303 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  57.3 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 		 297 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  56.49 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  56.14 
 
 		 304 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  57.65 
 
 		 299 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  50.5 
 
 		 301 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 		 302 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  51.25 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  49.17 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  51.42 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  59.18 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  59.18 
 
 		 297 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  54.48 
 
 		 301 aa  277  1e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  52.31 
 
 		 300 aa  276  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  54.14 
 
 		 301 aa  276  5e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  58.36 
 
 		 299 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  58.43 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  51.58 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  52.67 
 
 		 302 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  51.23 
 
 		 300 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  51.23 
 
 		 300 aa  272  7e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 		 301 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 		 301 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  54.12 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  51.79 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  51.22 
 
 		 297 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  51.6 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  51.88 
 
 		 302 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  52.14 
 
 		 301 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  52.14 
 
 		 298 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  51.6 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  53.57 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  53.57 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  48.44 
 
 		 299 aa  252  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  54.45 
 
 		 294 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  54.09 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  48.77 
 
 		 304 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  46.31 
 
 		 311 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  50.89 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.68 
 
 		 535 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.38 
 
 		 318 aa  215  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  45.04 
 
 		 306 aa  212  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 		 534 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  39.61 
 
 		 312 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  44.13 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.88 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  40.59 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  41.33 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.6 
 
 		 622 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>