More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15280 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 294 aa  578  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  63.7 
 
 		 304 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  58.36 
 
 		 312 aa  348  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  61.02 
 
 		 293 aa  342  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  64.38 
 
 		 294 aa  338  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  61.54 
 
 		 339 aa  326  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  62.24 
 
 		 342 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  60 
 
 		 332 aa  323  2e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  59.93 
 
 		 289 aa  318  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  53.98 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  55.02 
 
 		 326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  56.46 
 
 		 307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  54.45 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  54.76 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  57.14 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  55.94 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  55.71 
 
 		 315 aa  295  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  51.04 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  57.44 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  54.33 
 
 		 319 aa  288  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  51.37 
 
 		 335 aa  281  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  52.72 
 
 		 310 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  52.72 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  52.72 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  52.9 
 
 		 341 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  51.93 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 306 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  49.13 
 
 		 308 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  48.28 
 
 		 325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  52.6 
 
 		 328 aa  248  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  54.36 
 
 		 297 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44.67 
 
 		 317 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.25 
 
 		 535 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.14 
 
 		 534 aa  221  8e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  45.3 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  46.34 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  43.54 
 
 		 622 aa  209  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  48.26 
 
 		 586 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 324 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  45.98 
 
 		 312 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 624 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.98 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  45.77 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  45.77 
 
 		 353 aa  199  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  41.36 
 
 		 315 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  43.84 
 
 		 313 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 		 308 aa  195  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 312 aa  195  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 323 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 		 295 aa  191  9e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  42.97 
 
 		 345 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.94 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  45.14 
 
 		 443 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 302 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 316 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.61 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 483 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  38.62 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 321 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  41.54 
 
 		 294 aa  179  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  44.71 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  41.18 
 
 		 294 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  47.64 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>