More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1505 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 622 aa  1234    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  37.43 
 
 		 534 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  38.11 
 
 		 535 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  36.12 
 
 		 624 aa  271  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  48.51 
 
 		 317 aa  253  1e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  48.28 
 
 		 323 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  48.28 
 
 		 323 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  47.19 
 
 		 318 aa  238  3e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  47.39 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 		 302 aa  232  1e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  37.36 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 312 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  47.22 
 
 		 323 aa  227  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  46.53 
 
 		 328 aa  226  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  47.35 
 
 		 296 aa  226  9e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  44.2 
 
 		 317 aa  224  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  34.72 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  47.54 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  46.34 
 
 		 443 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  35.78 
 
 		 482 aa  217  5.9999999999999996e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  43.46 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  46.42 
 
 		 317 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 		 289 aa  213  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  48.41 
 
 		 586 aa  213  9e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 298 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  42.57 
 
 		 308 aa  213  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 		 472 aa  212  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 299 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 303 aa  212  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  43.65 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 		 315 aa  212  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  43.65 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  43.65 
 
 		 310 aa  211  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 313 aa  210  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  48.28 
 
 		 297 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.44 
 
 		 316 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  40.64 
 
 		 303 aa  207  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.74 
 
 		 318 aa  207  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 		 321 aa  206  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 312 aa  206  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.11 
 
 		 302 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 301 aa  205  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  40.54 
 
 		 328 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  43.54 
 
 		 294 aa  204  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  43.28 
 
 		 301 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  43.01 
 
 		 295 aa  204  6e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  41.35 
 
 		 317 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  43.28 
 
 		 301 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  33.96 
 
 		 495 aa  204  6e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  43.28 
 
 		 301 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  40.99 
 
 		 297 aa  203  8e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 		 316 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 301 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 		 315 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 296 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  42.43 
 
 		 342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.67 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 313 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  44.21 
 
 		 309 aa  202  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  40.57 
 
 		 326 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 306 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 301 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 313 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 		 316 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  40.41 
 
 		 304 aa  201  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 301 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 		 315 aa  200  5e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 305 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 310 aa  201  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 300 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 311 aa  200  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 300 aa  199  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 		 297 aa  199  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  40.64 
 
 		 302 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 321 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 304 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 341 aa  198  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 304 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  34.12 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  40.42 
 
 		 305 aa  197  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  38.97 
 
 		 325 aa  197  6e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 313 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 		 311 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  44 
 
 		 294 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 301 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  42.54 
 
 		 301 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 312 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  42.42 
 
 		 313 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  40.37 
 
 		 342 aa  195  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 300 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  39.46 
 
 		 317 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 300 aa  195  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>