More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0170 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
302 aa  607  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  84.49 
 
 
301 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  81.97 
 
 
303 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  90.79 
 
 
304 aa  511  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  80.07 
 
 
301 aa  497  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  83.72 
 
 
301 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  84.72 
 
 
300 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  81.4 
 
 
301 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  81.4 
 
 
301 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  81.4 
 
 
301 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  81.06 
 
 
301 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  80.4 
 
 
300 aa  482  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  80.4 
 
 
300 aa  477  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  80.4 
 
 
300 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  80.73 
 
 
300 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  81.33 
 
 
299 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  62.46 
 
 
305 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  63 
 
 
299 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  65.6 
 
 
317 aa  363  3e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  67.03 
 
 
304 aa  351  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  58.33 
 
 
303 aa  349  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  60.47 
 
 
305 aa  341  8e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  61.94 
 
 
296 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  61.46 
 
 
299 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  59.86 
 
 
304 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  59.86 
 
 
304 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  58.5 
 
 
306 aa  322  3e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  61.11 
 
 
297 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  61.94 
 
 
299 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  60.14 
 
 
302 aa  311  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  61.05 
 
 
294 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  55.02 
 
 
302 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  60.7 
 
 
294 aa  308  5.9999999999999995e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  53.71 
 
 
299 aa  305  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  53.92 
 
 
311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  61.05 
 
 
297 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  60.67 
 
 
297 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  59.19 
 
 
297 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  51.35 
 
 
298 aa  293  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  51.34 
 
 
305 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  49.18 
 
 
301 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  52.67 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  48.16 
 
 
310 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 
304 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  49.17 
 
 
301 aa  281  9e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  51.25 
 
 
311 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  48.12 
 
 
300 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 
297 aa  277  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  52.22 
 
 
305 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  52.22 
 
 
305 aa  276  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  48.12 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  48.12 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  48.12 
 
 
300 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  48.46 
 
 
300 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  47.16 
 
 
313 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  48.46 
 
 
300 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  47.16 
 
 
313 aa  275  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 
300 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  51.74 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  47.26 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  54.58 
 
 
309 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
306 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
306 aa  272  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  47.51 
 
 
302 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  53.06 
 
 
300 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  48.65 
 
 
297 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  53.47 
 
 
301 aa  270  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  48.68 
 
 
306 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  53.47 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  47.12 
 
 
301 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  48.46 
 
 
297 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  47.26 
 
 
301 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  47.44 
 
 
300 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  47.85 
 
 
311 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  50.35 
 
 
298 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  49.31 
 
 
300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 
306 aa  258  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  46.71 
 
 
298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 
323 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 
323 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.67 
 
 
328 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.75 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.29 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 
315 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 
315 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 
312 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  41.91 
 
 
312 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 
535 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 
323 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  41.69 
 
 
317 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>