More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0224 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  82.43 
 
 
535 aa  853    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
534 aa  1033    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  37.43 
 
 
622 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  55.99 
 
 
586 aa  274  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  53.26 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  54.74 
 
 
302 aa  265  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  49.13 
 
 
312 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  48.08 
 
 
317 aa  246  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  46.37 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  46.02 
 
 
323 aa  243  6e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  48.39 
 
 
296 aa  241  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  46.1 
 
 
305 aa  239  6.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  47.16 
 
 
306 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 
307 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  50.54 
 
 
624 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  44.8 
 
 
303 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.73 
 
 
318 aa  234  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  47.7 
 
 
323 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  45.17 
 
 
328 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 
298 aa  232  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
326 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  45.61 
 
 
315 aa  230  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 
301 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  47.7 
 
 
324 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 
312 aa  226  8e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 
300 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  47.74 
 
 
318 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  43.3 
 
 
300 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
295 aa  224  3e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.32 
 
 
299 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  46.37 
 
 
328 aa  224  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 
301 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
300 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 
289 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  46.55 
 
 
313 aa  223  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 
313 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 
300 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  40.74 
 
 
301 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  44.14 
 
 
294 aa  221  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 
300 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
306 aa  220  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
306 aa  220  6e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  42.28 
 
 
313 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 
317 aa  219  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  45.23 
 
 
312 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
305 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  42.28 
 
 
313 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  46.07 
 
 
309 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
298 aa  218  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 
298 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 
310 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 
304 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
304 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 
296 aa  217  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  40.91 
 
 
301 aa  217  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  46.34 
 
 
307 aa  217  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 
316 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 
312 aa  216  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 
316 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  44.86 
 
 
328 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  44.86 
 
 
328 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 
302 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.56 
 
 
315 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  42.57 
 
 
317 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  45.74 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 
312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 
353 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 
302 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 
313 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 
309 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  42.35 
 
 
311 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  46.43 
 
 
299 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.04 
 
 
316 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.99 
 
 
302 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 
301 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  42.56 
 
 
300 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  41.94 
 
 
297 aa  211  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 
297 aa  211  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
313 aa  210  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  40.63 
 
 
335 aa  210  5e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 
300 aa  210  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
297 aa  210  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
313 aa  210  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  45.71 
 
 
297 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  40.52 
 
 
317 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  41.94 
 
 
310 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
333 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  43.73 
 
 
305 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
310 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  46.18 
 
 
314 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>