More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0708 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  77.85 
 
 		 624 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  65.07 
 
 		 312 aa  353  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 317 aa  246  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  49.64 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  49.29 
 
 		 323 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  49.29 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  49.29 
 
 		 535 aa  241  7.999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  48.39 
 
 		 534 aa  240  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  52.48 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  47.35 
 
 		 622 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  50.71 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  48.03 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  46.45 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  45.55 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  49.29 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  47.39 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  45.83 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  45.83 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  43.66 
 
 		 301 aa  216  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  45.83 
 
 		 310 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  44.83 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 		 301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  45.16 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 328 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 		 318 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  45.82 
 
 		 443 aa  209  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  45.77 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 313 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  48.64 
 
 		 586 aa  209  6e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 316 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 302 aa  206  4e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  44.17 
 
 		 313 aa  205  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  46.1 
 
 		 314 aa  205  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  41.2 
 
 		 305 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  43.79 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  41.89 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  42.34 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  42.25 
 
 		 317 aa  202  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  43.36 
 
 		 342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  43.46 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 		 301 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  46.57 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 313 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  41.3 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 311 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.44 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  40.64 
 
 		 297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.45 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 315 aa  196  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  38.7 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  38.7 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  40.64 
 
 		 297 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>