More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2375 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 335 aa  665    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  67.51 
 
 		 328 aa  411  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  66.23 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  66.23 
 
 		 333 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  66.23 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  62.33 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  59 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  64.53 
 
 		 313 aa  365  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  64.58 
 
 		 313 aa  363  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  60.07 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 		 317 aa  331  9e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  52.6 
 
 		 317 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  54.26 
 
 		 317 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  49.84 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  51.79 
 
 		 321 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  52.11 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  50.31 
 
 		 328 aa  282  7.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  54.2 
 
 		 314 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  51.94 
 
 		 289 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  53.85 
 
 		 315 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  51.92 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  51.37 
 
 		 294 aa  275  9e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  54.2 
 
 		 294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  47.38 
 
 		 341 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  52.84 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  54.2 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.18 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  51.99 
 
 		 307 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  48.93 
 
 		 342 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  46.82 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  47.72 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  47.76 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  47.96 
 
 		 306 aa  255  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.8 
 
 		 317 aa  236  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.28 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.28 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  47.9 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  44.76 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  44.15 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  45.88 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  46.59 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.63 
 
 		 534 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 		 324 aa  199  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  40.26 
 
 		 535 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  38.01 
 
 		 483 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  44.72 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.08 
 
 		 622 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  44.8 
 
 		 624 aa  189  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 316 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  40.99 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 316 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  39.62 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 315 aa  182  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  41.4 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  40.26 
 
 		 311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 		 313 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  46.26 
 
 		 310 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  38.56 
 
 		 472 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  42.53 
 
 		 312 aa  179  8e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 586 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  42.74 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  42.74 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  40.79 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  38.93 
 
 		 495 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 315 aa  176  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 312 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  44.49 
 
 		 317 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  37.7 
 
 		 302 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  41.56 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  41.1 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  43.22 
 
 		 317 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  39.44 
 
 		 301 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 306 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  47.6 
 
 		 312 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  41.63 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>