More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2852 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 483 aa  942    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  55.88 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  55.42 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  53.96 
 
 		 482 aa  425  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  54.41 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  53.02 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  37.36 
 
 		 622 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  42.23 
 
 		 312 aa  226  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 317 aa  208  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 293 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 		 321 aa  204  4e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 304 aa  203  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  44.21 
 
 		 326 aa  203  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  34.25 
 
 		 535 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 		 319 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 294 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 		 315 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  38.01 
 
 		 335 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 317 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  45.33 
 
 		 328 aa  193  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 		 332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 		 310 aa  190  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 		 333 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 		 333 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  37.98 
 
 		 295 aa  189  9e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 305 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  42.38 
 
 		 302 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 		 328 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 306 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  40.47 
 
 		 307 aa  187  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 323 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 		 317 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  42.09 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  39.35 
 
 		 304 aa  186  9e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 		 318 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 		 308 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 		 325 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  41.93 
 
 		 317 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 294 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 		 342 aa  183  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  38.26 
 
 		 313 aa  183  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 302 aa  182  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  40.81 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  40.06 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 		 316 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  43.27 
 
 		 311 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  38.74 
 
 		 310 aa  180  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  38.19 
 
 		 314 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 		 315 aa  180  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 301 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 313 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 		 308 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  37.41 
 
 		 323 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  40.42 
 
 		 302 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 		 315 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  37.97 
 
 		 316 aa  177  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 300 aa  176  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 313 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  37.88 
 
 		 306 aa  176  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  37.88 
 
 		 306 aa  176  9e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  40.3 
 
 		 312 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  39.74 
 
 		 301 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 		 300 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  52.38 
 
 		 276 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 300 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  39.03 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 316 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  39.24 
 
 		 312 aa  173  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 		 295 aa  173  6.999999999999999e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 353 aa  173  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.71 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 		 310 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 312 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>