More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3899 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
302 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  88.19 
 
 
306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  88.19 
 
 
306 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  80.2 
 
 
301 aa  494  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  80.2 
 
 
304 aa  481  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  80.34 
 
 
301 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  81.52 
 
 
300 aa  472  1e-132  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  81.6 
 
 
298 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  78.22 
 
 
306 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  74.49 
 
 
305 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  75.84 
 
 
311 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  62.84 
 
 
301 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  65.31 
 
 
300 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  64.97 
 
 
300 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  64.97 
 
 
300 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  64.97 
 
 
300 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  63.51 
 
 
301 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  64.97 
 
 
300 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  64.97 
 
 
300 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  62.93 
 
 
300 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  62.93 
 
 
300 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  62.93 
 
 
300 aa  367  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  62.59 
 
 
300 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  62.33 
 
 
310 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  62.59 
 
 
300 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  65.02 
 
 
313 aa  364  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  62.59 
 
 
300 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  62.93 
 
 
300 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  62.59 
 
 
300 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  65.02 
 
 
313 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  63.51 
 
 
301 aa  362  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  64.54 
 
 
312 aa  360  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  64.29 
 
 
300 aa  360  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  64.18 
 
 
311 aa  360  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  60.33 
 
 
297 aa  345  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  61.74 
 
 
298 aa  341  7e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  57.86 
 
 
297 aa  340  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  57.59 
 
 
298 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  61.72 
 
 
298 aa  309  4e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 
299 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  57.45 
 
 
302 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  51.37 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  48.66 
 
 
303 aa  279  4e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  48.49 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 
298 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 
306 aa  268  7e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  47.64 
 
 
301 aa  267  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  49.33 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 
301 aa  263  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  49.49 
 
 
317 aa  262  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 
301 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  47.51 
 
 
302 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  44.93 
 
 
303 aa  258  8e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  48.26 
 
 
301 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  49.15 
 
 
300 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  46.49 
 
 
301 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  48.44 
 
 
299 aa  255  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  47.81 
 
 
300 aa  255  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  47.81 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
296 aa  253  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  47.32 
 
 
300 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 
304 aa  252  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 
304 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  46.8 
 
 
300 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  46.18 
 
 
305 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  46.18 
 
 
305 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  48.42 
 
 
304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  45.75 
 
 
305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  46.46 
 
 
301 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  46.46 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  46.46 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  46.13 
 
 
301 aa  242  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  47.3 
 
 
297 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  47.51 
 
 
304 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 
294 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  46.51 
 
 
300 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  49.12 
 
 
294 aa  236  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  47.26 
 
 
299 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 
311 aa  232  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  47.6 
 
 
297 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  47.97 
 
 
297 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  46.95 
 
 
297 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 
318 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
315 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  45.73 
 
 
299 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  46.84 
 
 
299 aa  222  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 
535 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  41.49 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 
328 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 
328 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 
534 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 
312 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
313 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  41.99 
 
 
302 aa  208  1e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
315 aa  208  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.2 
 
 
313 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.91 
 
 
312 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 
325 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>