More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0044 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 303 aa  603  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  65.35 
 
 		 306 aa  371  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  67.49 
 
 		 296 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  62.59 
 
 		 305 aa  362  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  66.89 
 
 		 297 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  64.83 
 
 		 299 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  64.29 
 
 		 304 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  64.29 
 
 		 304 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  58.53 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  59.2 
 
 		 301 aa  345  8e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  59.4 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  65.83 
 
 		 297 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  67.04 
 
 		 297 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  62.41 
 
 		 301 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  58.33 
 
 		 302 aa  338  9e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  59.73 
 
 		 300 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  67.04 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  59.4 
 
 		 300 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  58.08 
 
 		 301 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  59.06 
 
 		 300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  64.71 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  57.09 
 
 		 299 aa  331  9e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 301 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 301 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 301 aa  328  8e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  56.01 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  57.14 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  58.42 
 
 		 304 aa  315  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  59.39 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  58.01 
 
 		 298 aa  311  6.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  53.2 
 
 		 298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  57.45 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 300 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  55.2 
 
 		 301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 300 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  59.22 
 
 		 294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 		 300 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 		 300 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  52.35 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  58.25 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  53.24 
 
 		 301 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  52.56 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  52.56 
 
 		 313 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  58.51 
 
 		 294 aa  299  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 		 297 aa  298  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  54.8 
 
 		 312 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  52.17 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  54.09 
 
 		 311 aa  297  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  52.17 
 
 		 301 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  51.85 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  55.91 
 
 		 299 aa  292  5e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  49.15 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  53.58 
 
 		 297 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  56.21 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  53.24 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 301 aa  285  9e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  52.11 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  55.2 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  50.7 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  50.7 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  48.66 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  50.18 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  55.87 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  48.01 
 
 		 304 aa  272  6e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  52.31 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 		 300 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  49.1 
 
 		 298 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  49.46 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  48.44 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 		 295 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  45.52 
 
 		 535 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  41.88 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.8 
 
 		 534 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.21 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 312 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  43.84 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.27 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  44.53 
 
 		 295 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 		 313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 		 313 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>