More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3828 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 305 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  75.79 
 
 		 301 aa  441  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  79.73 
 
 		 311 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  74.49 
 
 		 302 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  74.83 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  74.83 
 
 		 306 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  70.57 
 
 		 304 aa  422  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  72.38 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  70.81 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  73.85 
 
 		 298 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  72.54 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  63.67 
 
 		 300 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  63.33 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  64.73 
 
 		 300 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  65.07 
 
 		 300 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  64.36 
 
 		 301 aa  371  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  63.64 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  64.73 
 
 		 300 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  61.46 
 
 		 301 aa  371  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  64.73 
 
 		 300 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  63.3 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  62.79 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  63.23 
 
 		 313 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  63.23 
 
 		 313 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  63.01 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  64.04 
 
 		 301 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  61.41 
 
 		 297 aa  356  2.9999999999999997e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  61.07 
 
 		 297 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  63.36 
 
 		 300 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  59 
 
 		 298 aa  347  2e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  66.9 
 
 		 298 aa  329  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  56.7 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  60.29 
 
 		 298 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  56.76 
 
 		 306 aa  305  5.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  52.35 
 
 		 303 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  51.85 
 
 		 302 aa  287  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  58.66 
 
 		 302 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  51.23 
 
 		 301 aa  285  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  50.51 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  53.45 
 
 		 317 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  52.86 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 		 300 aa  281  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  51.34 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  52.33 
 
 		 300 aa  280  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  55.44 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  52.56 
 
 		 300 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  53.1 
 
 		 297 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  52.94 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  52.6 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  52.04 
 
 		 301 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  53.45 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  53.45 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  53.87 
 
 		 300 aa  269  5e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  51.71 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  51.71 
 
 		 305 aa  265  5e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  54.04 
 
 		 299 aa  265  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  53.87 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  53.77 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  52.1 
 
 		 300 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  53.06 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  52.38 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  47.74 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  50.35 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  48.99 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  52.82 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  53.68 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  52.4 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 297 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  50.35 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  51.66 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  47.16 
 
 		 535 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  46.1 
 
 		 534 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.33 
 
 		 315 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  47.89 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  46.83 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 323 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  45.55 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  46.69 
 
 		 315 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>