More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0319 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
315 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  62.14 
 
 
317 aa  340  2e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  54.19 
 
 
325 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  56.7 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  53.14 
 
 
316 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 
316 aa  308  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  54.11 
 
 
316 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  55.85 
 
 
315 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  55.44 
 
 
315 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  55.44 
 
 
312 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  54.9 
 
 
315 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  52.98 
 
 
309 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  55.23 
 
 
317 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  55.23 
 
 
317 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  57.63 
 
 
317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  54.9 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  52.84 
 
 
308 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  51.93 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  51.93 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  54.9 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  55.43 
 
 
345 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 
310 aa  279  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 
330 aa  279  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  52.08 
 
 
321 aa  278  8e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  46.96 
 
 
295 aa  277  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  52.58 
 
 
316 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  51.3 
 
 
313 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  52.41 
 
 
304 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 
302 aa  275  1.0000000000000001e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  51.82 
 
 
312 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  51.82 
 
 
353 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  52.28 
 
 
310 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  51.82 
 
 
328 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  51.82 
 
 
328 aa  272  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  50.71 
 
 
312 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  47.9 
 
 
295 aa  269  5e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  51.19 
 
 
302 aa  267  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  52.73 
 
 
317 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  54.95 
 
 
312 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  53.12 
 
 
328 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  52.55 
 
 
313 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  46.4 
 
 
295 aa  256  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  47.44 
 
 
316 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  52.73 
 
 
317 aa  255  7e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  50.32 
 
 
311 aa  255  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 
309 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  43.28 
 
 
301 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
301 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
302 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  41.21 
 
 
303 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  41.3 
 
 
299 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  45.93 
 
 
443 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.67 
 
 
302 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 
302 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
324 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
296 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  43.2 
 
 
304 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
306 aa  217  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
306 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 
317 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  42.33 
 
 
305 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 
304 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 
622 aa  212  7e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 
318 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 
311 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
311 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.56 
 
 
534 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  43.69 
 
 
300 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
300 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
300 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
300 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 
300 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 
306 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  41.69 
 
 
297 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
535 aa  207  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 
298 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 
300 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
328 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  43.39 
 
 
298 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 
300 aa  206  5e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
305 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
305 aa  204  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  40.75 
 
 
302 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  41.08 
 
 
300 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  40.41 
 
 
301 aa  203  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
323 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
323 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
301 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>