More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3789 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  91.69 
 
 
301 aa  544  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  92.03 
 
 
301 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  92.03 
 
 
301 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  92.03 
 
 
301 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  88.37 
 
 
300 aa  524  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  88.37 
 
 
300 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  88.04 
 
 
300 aa  520  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  87.38 
 
 
300 aa  518  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  81.33 
 
 
303 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  80 
 
 
301 aa  494  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  81.73 
 
 
301 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  80.07 
 
 
302 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  81.4 
 
 
300 aa  472  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0190  protoheme IX farnesyltransferase  81.19 
 
 
304 aa  461  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3491  protoheme IX farnesyltransferase  77.93 
 
 
299 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  62.67 
 
 
317 aa  367  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  61.13 
 
 
305 aa  362  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  65.95 
 
 
299 aa  355  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  62.68 
 
 
305 aa  341  7e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  64.87 
 
 
304 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  58.08 
 
 
303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  59.57 
 
 
296 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  56.71 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  56.71 
 
 
304 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 
311 aa  306  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  59.01 
 
 
297 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  56.8 
 
 
299 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  56.04 
 
 
306 aa  305  7e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  53.55 
 
 
299 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  58.87 
 
 
299 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 
294 aa  298  8e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 
294 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 
302 aa  297  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  58.01 
 
 
302 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  50.5 
 
 
312 aa  288  9e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  50.83 
 
 
311 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  51.36 
 
 
298 aa  285  5e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  50.72 
 
 
301 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  58.27 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  50.52 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 
310 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  50.68 
 
 
305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  57.89 
 
 
297 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  50.52 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  56.93 
 
 
297 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  50.9 
 
 
300 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  54.33 
 
 
297 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  50.86 
 
 
300 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 
300 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  50.86 
 
 
300 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 
300 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 
300 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  49.32 
 
 
298 aa  278  1e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
304 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  55.21 
 
 
300 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 
301 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  54.51 
 
 
301 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  50.7 
 
 
301 aa  275  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  51.25 
 
 
297 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 
305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 
305 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  50.36 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  48.56 
 
 
301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  49.82 
 
 
297 aa  270  2e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  47.68 
 
 
301 aa  270  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 
309 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 
300 aa  264  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  50.89 
 
 
298 aa  260  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 
306 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  48.76 
 
 
306 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  48.76 
 
 
306 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  46.49 
 
 
302 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  50.53 
 
 
306 aa  256  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  48.2 
 
 
298 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  48.59 
 
 
298 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 
311 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  48.59 
 
 
300 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
302 aa  224  2e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 
328 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 
323 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  43.46 
 
 
622 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 
323 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 
318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 
302 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 
316 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 
316 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 
305 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 
535 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
318 aa  203  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  38.56 
 
 
312 aa  203  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>