More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3461 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
328 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
328 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  94.44 
 
 
353 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  96.47 
 
 
312 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  82.37 
 
 
312 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  80.52 
 
 
313 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  80.52 
 
 
313 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  77.92 
 
 
313 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  79.1 
 
 
312 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  70.92 
 
 
315 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  60.13 
 
 
318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  56.91 
 
 
316 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
316 aa  338  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  63.32 
 
 
321 aa  335  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  58.75 
 
 
310 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  55.92 
 
 
315 aa  328  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  56.19 
 
 
312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  55.26 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  53.07 
 
 
325 aa  322  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  60.21 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  60.74 
 
 
317 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  60.89 
 
 
317 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  61.11 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  58.19 
 
 
316 aa  300  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  60.07 
 
 
317 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  54.05 
 
 
309 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  55.89 
 
 
308 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  59.34 
 
 
317 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  56.27 
 
 
313 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 
311 aa  288  9e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  56.94 
 
 
302 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  53.14 
 
 
305 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  52.9 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 
304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  56.18 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  52.9 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  52.28 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  55.33 
 
 
330 aa  282  7.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  51.31 
 
 
310 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  46.83 
 
 
295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  55.33 
 
 
317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  53.04 
 
 
328 aa  268  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  50.7 
 
 
302 aa  268  1e-70  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  45.67 
 
 
295 aa  266  5e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  46.95 
 
 
295 aa  252  6e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 
302 aa  222  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.55 
 
 
534 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 
535 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.07 
 
 
302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  43.77 
 
 
299 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  44.25 
 
 
301 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 
303 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  45.77 
 
 
305 aa  212  7.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 
306 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 
306 aa  212  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 
301 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  208  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  44.29 
 
 
302 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  44.95 
 
 
298 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  43.99 
 
 
300 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 
311 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  42.19 
 
 
301 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 
301 aa  206  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
328 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  205  9e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  43.14 
 
 
443 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.91 
 
 
309 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 
294 aa  202  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  42.57 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.14 
 
 
296 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  42.23 
 
 
313 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 
310 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
300 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 
306 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.54 
 
 
622 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
304 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
306 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 
298 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 
311 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 
303 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 
297 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
301 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
323 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
304 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>