More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2973 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
321 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  78.67 
 
 
325 aa  454  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  66.46 
 
 
317 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  70.31 
 
 
328 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  61.46 
 
 
317 aa  381  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 
328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  55.89 
 
 
312 aa  334  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  58.09 
 
 
314 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 
307 aa  318  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  55.66 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  53.04 
 
 
341 aa  305  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  56.27 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 
304 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  57.24 
 
 
293 aa  299  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  51.79 
 
 
335 aa  289  4e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  55.37 
 
 
339 aa  287  2e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  51.04 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  47.35 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  52.74 
 
 
289 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  52.13 
 
 
306 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  52.22 
 
 
342 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  50.98 
 
 
333 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  50.98 
 
 
333 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  51.35 
 
 
326 aa  276  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  50.65 
 
 
310 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  52.8 
 
 
294 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  51.19 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  48.89 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  49.18 
 
 
319 aa  272  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  47.85 
 
 
315 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  49.34 
 
 
308 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  50.67 
 
 
328 aa  270  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  47.37 
 
 
342 aa  270  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  49.35 
 
 
313 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  48.85 
 
 
313 aa  262  6e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  48.08 
 
 
307 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.62 
 
 
323 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.62 
 
 
323 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  47.39 
 
 
297 aa  208  8e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 
324 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 
318 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 
622 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
312 aa  198  9e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 
483 aa  191  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
535 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 
534 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 
624 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
302 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 
315 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  41.02 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.48 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 
312 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
328 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
328 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
315 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  39.57 
 
 
315 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
312 aa  181  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  39.78 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 
318 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  37.92 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 
312 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 
295 aa  176  5e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.12 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  35.48 
 
 
295 aa  171  2e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 
302 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 
306 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 
443 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 
472 aa  169  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  38.98 
 
 
478 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 
586 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  39.49 
 
 
313 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 
296 aa  169  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 
310 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 
310 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  35.94 
 
 
295 aa  166  4e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  40.47 
 
 
317 aa  166  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  39.48 
 
 
482 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  36.16 
 
 
305 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 
310 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  34.98 
 
 
303 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.93 
 
 
297 aa  162  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 
316 aa  162  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  40.47 
 
 
345 aa  162  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  35.92 
 
 
305 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 
311 aa  159  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  37.29 
 
 
304 aa  159  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  42.17 
 
 
294 aa  159  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 
313 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  42.17 
 
 
294 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>