More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2521 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 328 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  67.51 
 
 		 335 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  63.88 
 
 		 308 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  69.28 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  69.28 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  67.7 
 
 		 313 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  69.28 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  67.58 
 
 		 313 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  57.59 
 
 		 326 aa  354  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  55.67 
 
 		 307 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  56.1 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  51.86 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  52.75 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  51.37 
 
 		 312 aa  295  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  53.67 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  51.04 
 
 		 313 aa  282  5.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  55.24 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  50.67 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  47.81 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  52.28 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  52.58 
 
 		 319 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  50.71 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  51.92 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  51.92 
 
 		 294 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  48 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  51.03 
 
 		 307 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  48.29 
 
 		 326 aa  263  3e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  48.23 
 
 		 342 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  50.34 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  44.55 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  50.85 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  45.57 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  47.22 
 
 		 317 aa  245  6e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  46.48 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 342 aa  232  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  45.15 
 
 		 318 aa  225  6e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 323 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  49.31 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.95 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 534 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 323 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.29 
 
 		 535 aa  202  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.4 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 		 622 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 		 472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 		 296 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 483 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  40.38 
 
 		 482 aa  192  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  40.8 
 
 		 495 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 478 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38.76 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  41.12 
 
 		 452 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.07 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  39.36 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.91 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  42.5 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39.36 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  41.33 
 
 		 310 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  40.92 
 
 		 624 aa  175  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  40.36 
 
 		 302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  40.46 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  38.98 
 
 		 311 aa  172  1e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  40.08 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.78 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.44 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  39.44 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  39.85 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  39.85 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.08 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.08 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  39.08 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  39.41 
 
 		 317 aa  169  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  38.85 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  38.81 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  42.41 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  39.03 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  44.08 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.16 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>