More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2487 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
478 aa  936    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  63.16 
 
 
472 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  58.08 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  59.01 
 
 
482 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  55.42 
 
 
483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  57.54 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 
535 aa  237  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  35.16 
 
 
534 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
622 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
326 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 
317 aa  194  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
323 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 
323 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  39.2 
 
 
304 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 
328 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 
307 aa  188  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 
308 aa  186  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  41.72 
 
 
293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  39.17 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  39.17 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  39.39 
 
 
310 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  40.74 
 
 
326 aa  185  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 
312 aa  183  7e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  38.22 
 
 
317 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  37.42 
 
 
318 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 
302 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 
317 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 
342 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 
306 aa  180  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 
294 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  39.43 
 
 
342 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  38.51 
 
 
443 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  40.32 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  34.64 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  38.56 
 
 
313 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 
318 aa  174  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  38.98 
 
 
321 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  35.21 
 
 
295 aa  173  5.999999999999999e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 
301 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 
316 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39.68 
 
 
316 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
313 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  42.09 
 
 
339 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 
308 aa  171  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 
312 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  39.12 
 
 
314 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 
353 aa  170  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 
317 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 
328 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 
317 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 
312 aa  169  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 
301 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 
328 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 
328 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 
315 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 
315 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 
310 aa  167  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  36.54 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
289 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 
313 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  36.97 
 
 
332 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 
300 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
313 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 
300 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  39.03 
 
 
316 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 
301 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 
303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
300 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 
315 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
301 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 
294 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  36.39 
 
 
324 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 
300 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.46 
 
 
296 aa  162  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  41.4 
 
 
296 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 
297 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 
312 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 
297 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  36.9 
 
 
296 aa  160  3e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  45.21 
 
 
302 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 
328 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 
313 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  36.97 
 
 
302 aa  159  8e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  35.67 
 
 
304 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  38.16 
 
 
297 aa  159  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 
305 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>