More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2600 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 276 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  60.07 
 
 		 317 aa  321  8e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  58.48 
 
 		 328 aa  315  6e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  61.11 
 
 		 318 aa  310  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  60.15 
 
 		 323 aa  308  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  60.15 
 
 		 323 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  60.92 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  57.41 
 
 		 323 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  48.79 
 
 		 315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  48.79 
 
 		 312 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  46.97 
 
 		 289 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  45.49 
 
 		 315 aa  215  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  50.19 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  48.77 
 
 		 622 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  50.38 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  44.94 
 
 		 312 aa  198  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  46.97 
 
 		 308 aa  198  7e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  46.38 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  44.03 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  46.61 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  48.03 
 
 		 443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  46.18 
 
 		 316 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  41.89 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  45.17 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  47.51 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  45.76 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  49.58 
 
 		 302 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  45.95 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 316 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  46.38 
 
 		 306 aa  192  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  44.28 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  43.2 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  48.12 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  46.25 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  46.21 
 
 		 313 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 326 aa  191  9e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  44.53 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 		 310 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  44.18 
 
 		 313 aa  189  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  45.69 
 
 		 353 aa  188  7e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  46.04 
 
 		 313 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  48 
 
 		 341 aa  188  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  45.69 
 
 		 306 aa  188  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  45.69 
 
 		 312 aa  188  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  45.08 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  47.13 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  46.59 
 
 		 310 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  45.56 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  48.76 
 
 		 535 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  47.76 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  45.69 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  45.69 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  46.42 
 
 		 312 aa  185  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  41.85 
 
 		 317 aa  185  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  45.11 
 
 		 315 aa  185  7e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  51.65 
 
 		 624 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.63 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  45.53 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  44.92 
 
 		 316 aa  183  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  45.93 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  48.37 
 
 		 534 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  43.43 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  48.78 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  47.57 
 
 		 295 aa  182  8.000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  45.12 
 
 		 317 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  44.62 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  42.44 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 		 317 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  45.31 
 
 		 319 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  47.58 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  44.11 
 
 		 339 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  43.35 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  45.56 
 
 		 342 aa  178  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  44.63 
 
 		 301 aa  178  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  45.1 
 
 		 315 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 		 310 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  44.13 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  45.42 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  46.18 
 
 		 300 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  42.38 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  45.42 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  46.56 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  45.42 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  44.19 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  48.33 
 
 		 317 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  44.58 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  44.58 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  43.33 
 
 		 342 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  44.58 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>