More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4504 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 345 aa  680    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  54.19 
 
 		 318 aa  339  4e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  58.61 
 
 		 330 aa  316  5e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  50.16 
 
 		 325 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  53.61 
 
 		 315 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  51.25 
 
 		 315 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  51.25 
 
 		 312 aa  302  7.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  51.71 
 
 		 315 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  51.85 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 316 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  51.43 
 
 		 316 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  52.7 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  52.7 
 
 		 310 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  52.72 
 
 		 321 aa  295  6e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  52.53 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  53.58 
 
 		 313 aa  292  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  54.98 
 
 		 317 aa  291  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  53.18 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  51.59 
 
 		 353 aa  290  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  50.16 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  51.46 
 
 		 315 aa  290  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  54.66 
 
 		 317 aa  289  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  51.59 
 
 		 312 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 		 310 aa  288  9e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  50.15 
 
 		 313 aa  286  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  51.9 
 
 		 316 aa  285  8e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  53.94 
 
 		 317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  52.6 
 
 		 313 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  51.61 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  54.83 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  57.61 
 
 		 312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  54.71 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  47.8 
 
 		 304 aa  269  4e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  50.97 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 		 295 aa  266  5e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  51.38 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  47.37 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 302 aa  258  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  45.37 
 
 		 302 aa  253  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  50.2 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  42.24 
 
 		 295 aa  249  5e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  52.79 
 
 		 317 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  39.63 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  43.59 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 		 301 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  40.19 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.32 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  38.17 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  41.29 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  42.04 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  41.19 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  39.03 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0466  protoheme IX farnesyltransferase  44.62 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.622131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 323 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  43.27 
 
 		 301 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 324 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 		 297 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04028  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  40.71 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  38.02 
 
 		 534 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  42.69 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  39.42 
 
 		 535 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  41.14 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 		 317 aa  192  5e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.34 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  41.23 
 
 		 312 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  43.15 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 318 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  42.48 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  39.75 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  39.33 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  39.74 
 
 		 317 aa  190  2.9999999999999997e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  40 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  44.15 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>