More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0615 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 310 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  93.55 
 
 		 310 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  93.55 
 
 		 310 aa  577  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  68.37 
 
 		 313 aa  421  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  68.06 
 
 		 305 aa  419  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  71.05 
 
 		 309 aa  415  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  76.35 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  55.96 
 
 		 316 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  54.64 
 
 		 316 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  55.71 
 
 		 325 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 		 315 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  54.81 
 
 		 318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  54.83 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  55.71 
 
 		 315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  55.71 
 
 		 312 aa  305  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  56.27 
 
 		 310 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  53.31 
 
 		 316 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  56.38 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  57.71 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  55.87 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  54.05 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  52.36 
 
 		 312 aa  285  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 		 313 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  52.28 
 
 		 315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  57.04 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  57.41 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  57.04 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  58.15 
 
 		 317 aa  278  9e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  51.89 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  51.89 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  52.23 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  52.23 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  53 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  53.26 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  57.78 
 
 		 317 aa  268  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  51.92 
 
 		 308 aa  265  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  49.51 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  45.55 
 
 		 295 aa  261  8e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  45.45 
 
 		 295 aa  259  4e-68  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  52.45 
 
 		 317 aa  246  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  52.38 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  44.98 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.3 
 
 		 309 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  42.28 
 
 		 296 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  40.29 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 622 aa  195  9e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  42.27 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 298 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  38.56 
 
 		 535 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  42.29 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 534 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  43.1 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  37.58 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 		 289 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  41.44 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  39.56 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.51 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  38.13 
 
 		 317 aa  182  4.0000000000000006e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  38.26 
 
 		 299 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  44.32 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  39.87 
 
 		 443 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  37.41 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>