More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1239 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 316 aa  617  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  67.53 
 
 		 321 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  54.75 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  56.62 
 
 		 315 aa  345  8e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 		 312 aa  342  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  60.14 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  60.53 
 
 		 315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 316 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  58.28 
 
 		 312 aa  338  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  55.52 
 
 		 318 aa  338  9e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  60.13 
 
 		 313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  56.72 
 
 		 310 aa  334  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  54.25 
 
 		 316 aa  333  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  57.28 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  58.68 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  58.68 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  52.58 
 
 		 325 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  58.13 
 
 		 312 aa  323  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  58.13 
 
 		 353 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  59.65 
 
 		 316 aa  321  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  58.97 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  59.74 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  59.11 
 
 		 317 aa  315  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  60.98 
 
 		 317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  60.98 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  58.04 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  52.76 
 
 		 309 aa  301  8.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  53.33 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  53.33 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  53.5 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 311 aa  292  4e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  55.31 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  49.84 
 
 		 313 aa  279  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  47.44 
 
 		 315 aa  278  7e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  49.52 
 
 		 330 aa  276  2e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  53.17 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  50.34 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  49.3 
 
 		 302 aa  271  8.000000000000001e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  51.93 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  50.16 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  54.01 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  48.92 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  45.23 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  45.9 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 		 622 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.91 
 
 		 302 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  44.17 
 
 		 535 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 		 534 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  46.69 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  43.85 
 
 		 443 aa  202  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  40.88 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 311 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 302 aa  199  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.21 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 328 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  42.22 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  42.67 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  39.4 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  38.54 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 		 324 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  39.79 
 
 		 326 aa  186  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 		 307 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  40.52 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  38.52 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>