More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2263 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
317 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  66.33 
 
 
326 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  64.41 
 
 
307 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 
335 aa  331  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  56.58 
 
 
308 aa  328  6e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
313 aa  326  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  56.82 
 
 
313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
333 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
333 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  57.19 
 
 
310 aa  315  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  57.81 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  60.42 
 
 
293 aa  308  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  59.79 
 
 
317 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  56.27 
 
 
321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  56.1 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  54.67 
 
 
289 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  55.56 
 
 
325 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  56.48 
 
 
328 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 
304 aa  295  7e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  57.24 
 
 
314 aa  295  8e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  55.75 
 
 
312 aa  294  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  52.54 
 
 
341 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  51.27 
 
 
326 aa  288  1e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  54.76 
 
 
294 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  56.75 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  54.01 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  55.26 
 
 
342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  52.23 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  57.09 
 
 
328 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  53.75 
 
 
339 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 
294 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  57.76 
 
 
307 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  51.27 
 
 
319 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  49.84 
 
 
317 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  50.16 
 
 
342 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  51.02 
 
 
332 aa  256  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  45.61 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 
323 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  44.2 
 
 
622 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.24 
 
 
323 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 
318 aa  223  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 
328 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  52.5 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 
312 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 
323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
296 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 
535 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.52 
 
 
534 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  46.21 
 
 
302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 
345 aa  189  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.78 
 
 
443 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 
318 aa  185  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  39.07 
 
 
308 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 
483 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  49.03 
 
 
586 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  39.16 
 
 
302 aa  179  4e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 
311 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 
312 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  47.34 
 
 
308 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  41.48 
 
 
315 aa  175  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  43.9 
 
 
295 aa  175  8e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  40.94 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 
624 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  44.2 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  41.72 
 
 
495 aa  172  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
317 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 
313 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  41.22 
 
 
309 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
317 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  40.35 
 
 
316 aa  170  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 
300 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 
472 aa  170  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 
306 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 
316 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
300 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  51.11 
 
 
276 aa  169  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
317 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 
300 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 
315 aa  169  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 
312 aa  169  8e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 
315 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  40.45 
 
 
309 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  41.57 
 
 
317 aa  169  8e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 
301 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  39.07 
 
 
311 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  43.05 
 
 
482 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 
300 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>