More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11479 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
308 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  80.13 
 
 
310 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  79.8 
 
 
333 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  79.8 
 
 
333 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  80.2 
 
 
313 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  77.93 
 
 
313 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  63.88 
 
 
328 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  64.69 
 
 
326 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  62.33 
 
 
335 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  61.33 
 
 
307 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  56.58 
 
 
317 aa  328  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  48.55 
 
 
317 aa  278  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  51.51 
 
 
341 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  53.64 
 
 
317 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  51.22 
 
 
313 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  47.47 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 
289 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  49.34 
 
 
321 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
326 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  51.36 
 
 
328 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  51.58 
 
 
307 aa  269  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  49.13 
 
 
294 aa  266  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  49.67 
 
 
317 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  47.85 
 
 
314 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  52.13 
 
 
293 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  51.06 
 
 
342 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.04 
 
 
325 aa  256  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  53.15 
 
 
328 aa  256  4e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  46.44 
 
 
304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  47.14 
 
 
306 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  48.6 
 
 
315 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 
332 aa  252  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  47.55 
 
 
319 aa  246  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  47.51 
 
 
342 aa  238  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.39 
 
 
317 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  45.3 
 
 
339 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.72 
 
 
318 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  42.57 
 
 
622 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.52 
 
 
323 aa  212  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 
323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.79 
 
 
534 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 
324 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 
323 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 
535 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 
312 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  40.59 
 
 
328 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  45.16 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  41.3 
 
 
315 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
313 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 
302 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  45.52 
 
 
624 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 
315 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  43.36 
 
 
309 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.28 
 
 
325 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.25 
 
 
318 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
295 aa  187  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 
482 aa  186  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  41.29 
 
 
353 aa  185  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  41.26 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 
443 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 
495 aa  182  8.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 
478 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  42.25 
 
 
310 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 
302 aa  178  9e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 
308 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
586 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 
312 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 
295 aa  177  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  43.37 
 
 
310 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  43.37 
 
 
310 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 
317 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 
315 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 
483 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  40.54 
 
 
472 aa  176  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  43.25 
 
 
317 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 
317 aa  176  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 
317 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  35.98 
 
 
295 aa  175  9e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  43.02 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  48.02 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 
276 aa  171  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 
330 aa  171  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  42.29 
 
 
309 aa  170  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  42.75 
 
 
305 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>