More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2098 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 315 aa  630  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  91.75 
 
 		 319 aa  551  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  66.46 
 
 		 326 aa  415  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  57.1 
 
 		 304 aa  349  3e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  63.19 
 
 		 293 aa  348  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  54.81 
 
 		 312 aa  336  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  60.33 
 
 		 339 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  59.73 
 
 		 294 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  55.87 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 		 326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 307 aa  308  9e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 		 289 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  56.06 
 
 		 328 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  52.23 
 
 		 317 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  55.71 
 
 		 294 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  54.36 
 
 		 314 aa  299  5e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  56.49 
 
 		 342 aa  296  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  53.07 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  50.82 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  53.85 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  47.85 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  53.95 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  53.26 
 
 		 313 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  52.46 
 
 		 317 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  49.83 
 
 		 317 aa  275  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.97 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  48.18 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  48.6 
 
 		 308 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  47.64 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  52.45 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  51.55 
 
 		 297 aa  246  4e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  45 
 
 		 342 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  44.72 
 
 		 312 aa  229  4e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 317 aa  224  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  40.26 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.49 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 296 aa  205  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 535 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 		 483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  41.24 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 		 328 aa  199  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 		 313 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  39.16 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 624 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 300 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.51 
 
 		 302 aa  196  4.0000000000000005e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.22 
 
 		 622 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  40.35 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 300 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 311 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  40.56 
 
 		 534 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  40.63 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1388  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.454478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  39.26 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  37.99 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  38.18 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 296 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.18 
 
 		 443 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  39.56 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.53 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  39.56 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  38.98 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>