More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2075 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  78.67 
 
 		 289 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  67.76 
 
 		 307 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  55.41 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  57.14 
 
 		 312 aa  323  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  57.65 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  55.12 
 
 		 307 aa  309  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  56.46 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  54.48 
 
 		 317 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  57.8 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  50.77 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  51.86 
 
 		 304 aa  295  8e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  54.35 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  53 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  50.48 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  55.48 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  55.48 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  55.48 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  53 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  53.79 
 
 		 313 aa  285  7e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  51.35 
 
 		 308 aa  285  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  50.81 
 
 		 321 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  53.85 
 
 		 313 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  54.67 
 
 		 294 aa  281  7.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  53.17 
 
 		 342 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  50.32 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  49.03 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  52.74 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  49.35 
 
 		 328 aa  279  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  52.32 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  54.39 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.32 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  51.86 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  51.9 
 
 		 332 aa  261  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  49.06 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  52.8 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  47.64 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44.37 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  49.47 
 
 		 297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  44.9 
 
 		 622 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  46.21 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 534 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.69 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 		 443 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  48.01 
 
 		 302 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.64 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 315 aa  202  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  43.55 
 
 		 312 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 312 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 315 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  41.86 
 
 		 313 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  41.86 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  41.82 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  41.82 
 
 		 353 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 315 aa  188  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 		 308 aa  188  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  41.45 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  41.45 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 624 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.67 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  42.45 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.65 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  45.97 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.32 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  40.57 
 
 		 325 aa  182  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  43.82 
 
 		 586 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.57 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  41.7 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 317 aa  178  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.62 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 311 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  34.26 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  39.04 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  39.15 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>