More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1265 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 332 aa  673    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  75.93 
 
 		 294 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  68.26 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  66.44 
 
 		 293 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  63.75 
 
 		 342 aa  358  5e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  60 
 
 		 294 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  53.78 
 
 		 339 aa  316  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  55.87 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  54.15 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  54.86 
 
 		 312 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  55.9 
 
 		 289 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  56.42 
 
 		 326 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  53.52 
 
 		 307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  49.23 
 
 		 326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  51.6 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  48.89 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  51.42 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 317 aa  271  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  46.95 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  52.41 
 
 		 341 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  49.02 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  49.02 
 
 		 333 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  49.02 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  55.36 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  49.65 
 
 		 308 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  51.57 
 
 		 306 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  49.68 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  51.64 
 
 		 313 aa  262  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  49.48 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.43 
 
 		 313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  45.79 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  53.33 
 
 		 307 aa  252  7e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  46.96 
 
 		 297 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 		 317 aa  222  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.55 
 
 		 535 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  42.48 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  40.79 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  40.7 
 
 		 302 aa  201  9.999999999999999e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  41.14 
 
 		 328 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  38.49 
 
 		 483 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  44.33 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 		 312 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 		 534 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.4 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.85 
 
 		 622 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 306 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  42.24 
 
 		 624 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  36.97 
 
 		 295 aa  190  4e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 316 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 318 aa  189  8e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  43.01 
 
 		 296 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  42.31 
 
 		 313 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  40.77 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 312 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  40.35 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  41.97 
 
 		 313 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.51 
 
 		 303 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  40.43 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  37.34 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  42.12 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  38.69 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  37.34 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 443 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  38.3 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  38.08 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 		 297 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.51 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  40.42 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  37.65 
 
 		 472 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 297 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  37.29 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  40.86 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 586 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.28 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  41.54 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  36.48 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>