More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2060 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 306 aa  597  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  53.27 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  53.72 
 
 		 312 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  52.61 
 
 		 307 aa  302  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  53.51 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  56.46 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  56.75 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  56.86 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  53.77 
 
 		 289 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  54.46 
 
 		 307 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  52.13 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  53.63 
 
 		 293 aa  281  9e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  53.17 
 
 		 313 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  50.82 
 
 		 315 aa  280  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  52.12 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  54.18 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  51.55 
 
 		 304 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  51.41 
 
 		 317 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  52.58 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  52.92 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  50.17 
 
 		 319 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  50.33 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.89 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  52.16 
 
 		 339 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  47.96 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 342 aa  259  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  47.14 
 
 		 308 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  53.9 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  51.57 
 
 		 332 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  51.38 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  47.52 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  47.19 
 
 		 310 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.76 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  48.28 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  47.74 
 
 		 317 aa  235  7e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  47.93 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 323 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41.33 
 
 		 535 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 328 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  46.49 
 
 		 586 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 		 534 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  45.94 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.13 
 
 		 622 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.52 
 
 		 312 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.54 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.16 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  41.32 
 
 		 305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  42.07 
 
 		 483 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.75 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  44.57 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  40.62 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.95 
 
 		 443 aa  175  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  41.55 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 		 472 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 		 478 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  37.97 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.97 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  38.44 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.73 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.12 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  41.12 
 
 		 624 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.14 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  38.62 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  37.68 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  35.67 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  39.08 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  40.39 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  36.66 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  39.16 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 		 309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 		 308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  35.97 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  39.67 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 295 aa  165  9e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  38.29 
 
 		 482 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1051  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  38.24 
 
 		 495 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0943  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.449877  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 		 295 aa  163  3e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  38.85 
 
 		 315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  36.97 
 
 		 311 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0918  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  39.19 
 
 		 452 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  36.9 
 
 		 325 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0117  protoheme IX farnesyltransferase  39.08 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  37.21 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>