More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2160 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  70.99 
 
 
294 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  67.01 
 
 
304 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  68.26 
 
 
342 aa  375  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  66.44 
 
 
332 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  63.09 
 
 
339 aa  354  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  59.31 
 
 
312 aa  343  2e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  61.02 
 
 
294 aa  342  4e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  63.45 
 
 
315 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  62.07 
 
 
319 aa  328  7e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  60.14 
 
 
326 aa  325  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  57.49 
 
 
307 aa  318  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  60.42 
 
 
317 aa  315  4e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  57.64 
 
 
326 aa  315  6e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  57.24 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  59.38 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  58.19 
 
 
289 aa  311  9e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  57.34 
 
 
317 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  58.13 
 
 
307 aa  300  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  54.14 
 
 
328 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  52.55 
 
 
313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  55.4 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  53.12 
 
 
325 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  51.71 
 
 
314 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  53.63 
 
 
306 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  52.84 
 
 
335 aa  279  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  51.92 
 
 
328 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  54.08 
 
 
341 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  55.52 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 
333 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 
333 aa  268  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  51.2 
 
 
310 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  52.13 
 
 
308 aa  267  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.98 
 
 
313 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  55.17 
 
 
328 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  49.66 
 
 
313 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  43.45 
 
 
317 aa  237  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  53.74 
 
 
297 aa  229  4e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 
323 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 
323 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  46.67 
 
 
324 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.16 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 
535 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 
318 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  43.97 
 
 
534 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.48 
 
 
302 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 
483 aa  210  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 
312 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 
328 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 
622 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
296 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  43.51 
 
 
318 aa  201  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
472 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.23 
 
 
443 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  43.42 
 
 
624 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  42.81 
 
 
478 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 
302 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  42.46 
 
 
309 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 
295 aa  189  5e-47  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  41.96 
 
 
306 aa  189  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  42.25 
 
 
296 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 
312 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  39.12 
 
 
309 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
586 aa  185  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.44 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  41.84 
 
 
482 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  39.18 
 
 
310 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  42.91 
 
 
495 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 
299 aa  178  8e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0479  protoheme IX farnesyltransferase  42.8 
 
 
294 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 
315 aa  177  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  40.34 
 
 
304 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  41.87 
 
 
452 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  39.07 
 
 
301 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.1 
 
 
315 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 
304 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.1 
 
 
312 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 
297 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
311 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  39.59 
 
 
325 aa  175  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  38.77 
 
 
328 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  38.77 
 
 
328 aa  175  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  39.08 
 
 
298 aa  175  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  37.98 
 
 
316 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  38.74 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.41 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0455  protoheme IX farnesyltransferase  42.39 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  40.42 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 
353 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  36.68 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>