More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1558 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  73.9 
 
 		 294 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  67.01 
 
 		 293 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  68.26 
 
 		 332 aa  370  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  65.2 
 
 		 342 aa  355  6.999999999999999e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  63.7 
 
 		 294 aa  348  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  58.39 
 
 		 312 aa  345  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  58.39 
 
 		 339 aa  329  4e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  57.1 
 
 		 315 aa  327  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  55.48 
 
 		 317 aa  318  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  54.69 
 
 		 319 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  56.07 
 
 		 317 aa  315  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  56.16 
 
 		 326 aa  315  9e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  53.02 
 
 		 307 aa  312  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  54.33 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  54.55 
 
 		 321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  56.74 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  54.04 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 		 317 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  52.38 
 
 		 314 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  51.96 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  52.11 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  51.67 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  54.79 
 
 		 341 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  52.67 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  54.3 
 
 		 307 aa  275  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2215  protoheme IX farnesyltransferase  53.47 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125005  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  51.55 
 
 		 306 aa  269  4e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  51.8 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  49.31 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  48.83 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  48.83 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  48.83 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  48.44 
 
 		 313 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  48 
 
 		 328 aa  258  8e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  46.44 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  44.74 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  51.75 
 
 		 297 aa  239  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44.95 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  44.6 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  46.5 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  44.41 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  44.29 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  44.52 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  43.26 
 
 		 535 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.96 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.76 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  40.78 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  45.42 
 
 		 624 aa  199  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.32 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  39.66 
 
 		 483 aa  194  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  45.02 
 
 		 586 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  37.29 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  40.45 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3188  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1432  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0160  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2859  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0247  protoheme IX farnesyltransferase  39.94 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0187276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0228  protoheme IX farnesyltransferase  39.94 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  40.28 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.67 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  40.55 
 
 		 300 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 		 472 aa  189  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  42.02 
 
 		 443 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  39 
 
 		 622 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0372  protoheme IX farnesyltransferase  39.46 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591826  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  40.34 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  38.67 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  38.44 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  38.51 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 297 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 		 304 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  39.93 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  38.87 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  40.97 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 300 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>