More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06451 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_06451  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 333 aa  650    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04461  protoheme IX farnesyltransferase  79.33 
 
 		 333 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1752  protoheme IX farnesyltransferase  80.95 
 
 		 326 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0610  protoheme IX farnesyltransferase  80.39 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.864627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1779  protoheme IX farnesyltransferase  72.87 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05021  protoheme IX farnesyltransferase  73.09 
 
 		 331 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.196285 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05101  protoheme IX farnesyltransferase  74.1 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04721  protoheme IX farnesyltransferase  69.3 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05031  protoheme IX farnesyltransferase  69 
 
 		 333 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0447  protoheme IX farnesyltransferase  70.7 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.583784  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 		 317 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  44.01 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  43.71 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.67 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  43.86 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 328 aa  215  8e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  46.21 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  40.35 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 		 622 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  42.7 
 
 		 312 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.17 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.44 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  41.61 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  40.83 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  36.84 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  37.28 
 
 		 316 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 		 312 aa  162  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40.15 
 
 		 478 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  40.85 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.31 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  39.72 
 
 		 317 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  40.27 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  37.11 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  38.58 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 		 299 aa  156  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 		 328 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  41.45 
 
 		 302 aa  155  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  38.8 
 
 		 624 aa  155  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 325 aa  155  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  44.19 
 
 		 317 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  35.02 
 
 		 345 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  39.64 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  46.15 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  39.15 
 
 		 296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  38.13 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  39.53 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  40.52 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  38.99 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  40.94 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  38.97 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  40.57 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  35.27 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  37.6 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  41.67 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  35.92 
 
 		 313 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  39.33 
 
 		 342 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  42.5 
 
 		 483 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  37.99 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  44.34 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.12 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  40.36 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  35.53 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  35.55 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 		 317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  32.75 
 
 		 295 aa  146  5e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  36.04 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  39.07 
 
 		 305 aa  146  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  40.09 
 
 		 303 aa  146  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  40.89 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  42.04 
 
 		 535 aa  145  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  42.79 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.21 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  42.59 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  42.59 
 
 		 300 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>