More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0610 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0610  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 327 aa  637    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.864627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1752  protoheme IX farnesyltransferase  87.5 
 
 		 326 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04461  protoheme IX farnesyltransferase  80.39 
 
 		 333 aa  464  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06451  protoheme IX farnesyltransferase  80.39 
 
 		 333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05101  protoheme IX farnesyltransferase  73.79 
 
 		 332 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05021  protoheme IX farnesyltransferase  76.53 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.196285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1779  protoheme IX farnesyltransferase  76.53 
 
 		 331 aa  430  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0447  protoheme IX farnesyltransferase  72.49 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04721  protoheme IX farnesyltransferase  72.82 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05031  protoheme IX farnesyltransferase  72.49 
 
 		 333 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 		 317 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.47 
 
 		 318 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 		 328 aa  213  4.9999999999999996e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  47.83 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 		 622 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  43.17 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  44.49 
 
 		 312 aa  169  8e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  41.64 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 321 aa  165  9e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  42.59 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  39.34 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  43.54 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 		 316 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  37.2 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38.95 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  40.66 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  39.46 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  37.54 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  40.47 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 299 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  43.07 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  35.91 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  43.07 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  43.07 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  38.7 
 
 		 345 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  40.96 
 
 		 478 aa  152  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  42.79 
 
 		 317 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  41.28 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  39.47 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 		 339 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  37.25 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  35.56 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  45.67 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 		 297 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  42.13 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 295 aa  151  2e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  40.21 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  36.68 
 
 		 313 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  39.01 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  41.82 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  36.81 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  42.38 
 
 		 624 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  39.27 
 
 		 313 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  33.44 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  39.91 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  36.49 
 
 		 325 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  38.3 
 
 		 328 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  37.18 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  43.52 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 		 296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  40.34 
 
 		 443 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  39.22 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  43.52 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  43.52 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  38.54 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 		 535 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  36.45 
 
 		 353 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  38.13 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.71 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  37.15 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  37.15 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  37.15 
 
 		 312 aa  146  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  35.96 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  43.6 
 
 		 483 aa  145  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  42.79 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  37.13 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  39.29 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  43.06 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>