More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_05101 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_05101  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
332 aa  664    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05031  protoheme IX farnesyltransferase  89.51 
 
 
333 aa  540  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0447  protoheme IX farnesyltransferase  89.81 
 
 
333 aa  539  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.583784  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04721  protoheme IX farnesyltransferase  89.2 
 
 
333 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04461  protoheme IX farnesyltransferase  74.7 
 
 
333 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1752  protoheme IX farnesyltransferase  73.48 
 
 
326 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0610  protoheme IX farnesyltransferase  73.79 
 
 
327 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.864627  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05021  protoheme IX farnesyltransferase  74.84 
 
 
331 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.196285 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1779  protoheme IX farnesyltransferase  74.84 
 
 
331 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06451  protoheme IX farnesyltransferase  74.1 
 
 
333 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  42.55 
 
 
317 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  42.51 
 
 
318 aa  219  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 
323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 
323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 
328 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  38.36 
 
 
324 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  43.65 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  40.58 
 
 
312 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 
312 aa  161  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  35.11 
 
 
321 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38.11 
 
 
318 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
622 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 
307 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  44.12 
 
 
296 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  37.05 
 
 
317 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  34.92 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  34.92 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  38.35 
 
 
302 aa  156  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  42.13 
 
 
478 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 
328 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 
326 aa  155  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 
299 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  41.05 
 
 
302 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  41.35 
 
 
317 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  36.11 
 
 
316 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  41.45 
 
 
302 aa  154  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 
326 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  34.92 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  35.44 
 
 
299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  40.09 
 
 
313 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  36.47 
 
 
317 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 
310 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  37.1 
 
 
345 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 
333 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  37.72 
 
 
333 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
312 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
315 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 
305 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  37.77 
 
 
301 aa  150  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  34.41 
 
 
313 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  36.19 
 
 
308 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  36.23 
 
 
317 aa  149  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  35.6 
 
 
308 aa  149  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  39.15 
 
 
624 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  36.6 
 
 
317 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  35.19 
 
 
315 aa  149  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  37.11 
 
 
317 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  36.6 
 
 
317 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1463  protoheme IX farnesyltransferase  40.65 
 
 
298 aa  149  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  36.03 
 
 
298 aa  149  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  35.47 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  36.04 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.44 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  33.44 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  37.2 
 
 
535 aa  147  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 
304 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  37.9 
 
 
313 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.99 
 
 
296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 
310 aa  146  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 
305 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  36.7 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  36.04 
 
 
316 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
304 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  34.95 
 
 
313 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  37.61 
 
 
328 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  38.04 
 
 
305 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0335  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 
298 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0243688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  35.99 
 
 
328 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  35.99 
 
 
328 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  33.57 
 
 
313 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  35.46 
 
 
303 aa  143  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
312 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 
353 aa  142  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  39.65 
 
 
339 aa  143  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 
301 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 
314 aa  142  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  36.75 
 
 
335 aa  143  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  41.13 
 
 
298 aa  142  6e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3524  protoheme IX farnesyltransferase  40.44 
 
 
301 aa  142  6e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  32.41 
 
 
325 aa  142  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  37.55 
 
 
305 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  34.77 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  34.17 
 
 
303 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  38.08 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 
495 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 
472 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  41.01 
 
 
301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>